重组质粒快速抽提的方法
重组质粒DNA 的小量快速制备方法
(一) Lysis Trition 发抽提方法
1. 在LB 肉汤中(含适量抗生素)接种适量的菌种,37℃振荡培养过夜。
2. 将培养物倒入离心管,2000~2500rpm 离心10分钟,尽弃上清夜,收集沉淀。
3. 加入Lysis Sucrose 液250ul, 旋涡器上振荡使沉淀分散均匀,冰浴10分钟。
4. 加入Lysozyme 液(10mg/ml)25ul,旋涡器上振荡混匀,冰浴5分钟。
5. 加入0.25M EDTA液25ul ,旋涡器上振荡振荡混匀,冰浴5分钟。
6. 加入Lysis Trition 液125ul, 轻摇混匀,室温下作用2~15分钟,待裂解后,13,000rpm, 4℃离心15分钟,取上清。
7. 在上清液中加入饱和酚150ul ,来回颠倒数分钟,12,000rpm,4℃离心5分钟,取上清液。
8. 在上清液中加入饱和酚、氯仿各150ul ,来回颠倒数分钟,12,000rpm,4℃离心5分钟,取上清液。
9. 在上清液中加入氯仿150ul ,来回颠倒数分钟,12,000rpm,4℃离心5分钟,取上清液。
10. 在上清液中加入2倍量的异丙醇或95%的乙醇(-20℃预冷),作用一定时间后, 12,000rpm, 4℃离心20~25分钟,弃上清液。
11. 干燥沉淀。
12. 加入1ml70%乙醇,来回颠倒数次,12,000rpm,4℃离心5分钟,弃上清液
13. 真空干燥沉淀。
加入TE (ph8.0)20~50ul 溶解沉淀,4℃或-20℃保存。
附:小量快速抽提中的注意事项:
1.TritonX-100 溶解细菌的脂质层,在细菌脂质上打孔呈蜂窝状。
EDTA 络合DNA 酶的络合剂。
蔗糖 提供了酶作用的环境。
溶菌酶 用以溶解细菌的膜。
2. 溶解时,若溶解过头用酚/氯仿进行纯化DNA 时不易抽出蛋白质。大量制备时常用碱裂解法。
3. 酚使蛋白质变性,用氯仿萃取蛋白质,每次吸取上清时要注意不要吸入蛋白质、酚、氯仿,否则会影酶切效果。
4. 本实验中用的氯仿系氯仿与异戊醇的混合物(24:1)。
5. 最后进行干燥,可以用自然干燥,也可抽滤干燥(约30分钟)但必须充分干燥,否 则不易于被TE 所溶解和酶切。
6. 实验前准备中将转染了质粒的大肠杆菌接种于LB 肉汤时,铂耳不宜太烫,每次最后 接种环在试管壁轻轻敲打数次,以保证有效接种,摇振培养时试管的倾斜率、水位、温度都要作适当的选择,否则不宜培养。
(二) 碱裂解法
1. 将2ml 含相应抗生素的LB 加入到容量为1.5ml 并且通风良好(不盖紧)的试管中,然后接种入一单个菌落,于37℃振荡培养过夜。
2.将1.5ml 培养物倒入微量离心管中,用微量离心机于4℃以12,000rmp 离心30秒,将剩余的培养物贮存于4℃。
3. 吸去培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。
备注:除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连,轻缓抽吸,并用吸头接触液面,当液体从管中吸出时,尽可能使吸头远离细菌沉淀,然后继续用吸头通过抽真空去附于管壁上的液滴。
4. 将细菌沉淀重悬于100ul 用冰预冷的溶液1中,剧烈振荡。
溶液1:50mMol/L葡萄糖,25mM Tris.HCl(pH8.0),10mM EDTA(pH8.0)。可以成批地配制,每瓶约100ml ,在10磅高压灭菌15分钟,贮存于4℃。须使细菌沉淀在溶液1中完全分散,将两个微量离心管的底部互相接触同时进行振荡,可使沉淀迅速分散。
5. 加入200ul 新配制的溶液2,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物,应确保离心管的整个内表面与溶液2接触,不要振荡,将其置于冰上。
溶液2:0.2Mol/L NaOH(临用时用10Mol/L的贮存液现配)1%SDS。
6. 加150ul 用冰预冷的溶液3,(溶液3:5Mol/L 乙酸钾 60ml,冰醋酸11.5ml, 水28.5ml 配成溶液对K + 3M,对乙酸根是5Mol )盖紧管口,将管倒置后温和地振荡10秒钟使溶液3在粘
稠的细菌裂解物中分散均匀之后将管倒置于冰上3~5分钟。
7. 用微型离心机4℃12,000rmp ,离心5分钟,将上清转移到另一离心管中。
8. 可做可不做,加等量酚:氯仿,振荡混匀,用微量离心机于4℃12,000rmp ,离心2分钟,将上清转移到另一离心管中。
9.用2倍体积的乙醇于室温沉淀DNA ,振荡混合,于室温放置2分钟。
10. 用微量离心机4℃,12,000rmp ,离心5分钟。
11. 小心吸去上清,ᰆ㦻ῃ㮡ᰆ置于纸巾上,以使所有液体流出,再将吸附于管壁的液滴除尽。
12. 用1ml70% 乙醇于4℃洗涤双链DNA 沉淀,按步骤8所示方法去掉上清,在空气中使核酸沉淀干燥10分钟。
13. 用50ul 含无DNA 酶的胰RNA 酶(20ug/ml)的TE 重新溶解核酸,振荡,贮存于-20℃。
(三) 煮沸法制备质粒DNA
试剂:TETS 溶液:Tris-Hcl 10mM, TritonX-100 0.5%,EDTA 50mM,蔗糖8%。
溶菌酶溶液:Tris-Hcl 10Mm(Ph8.0), 溶菌酶10mg/ml。
Rnase-A溶液:用前80℃处理10分钟,Tris-Hcl 10mM ,EDTA 1mM (Ph8.0),Rnase-A 50ug/ml。
方法:1. 将没一个菌种接种于5mlLB 肉汤中,并加入合适的抗生素(根据重组质粒的抗性)于37℃振荡培养过夜。
2.取1.5ml 上述液至Eppendorf 管中(剩余4℃保存),8000rpm 离心5分钟,弃上清。
3.沉淀重悬于0.35mlTETS 溶液中,加入25ul 新配制的溶菌,混匀3秒钟以后将Eppendorf 管放入沸水40秒。
4.1800rmp离心10分钟,取上清至Eppendorf 管中,加420ul 异丙醇和40ul 的醋酸钠溶液,混匀并于乙醇干冰浴中15分钟,4℃,18000rmp 离心15分钟。
5.弃上清,加入50ul Rnase-A溶液,37℃作用10分钟。
6.取10ul 制品加入干净的Eppendorf 管中,在加1.2ul 合适的10×酶缓冲溶液,再加入1~2单位的限制性内切酶,电泳,观察。
7.剩余样品-20℃保存。