有没有病毒可能对人体「有益」?
Mr-HH，细胞生物学 / 遗传学 / 普通生物学科普
部分有的。
首先请大家先明确，原问题说的是，除了用来研究和做疫苗之外，题主想要知道存不存在像益生菌一样的「益生病毒」，这里列举了三个具体例子，请往下拉~
若有兴趣，还可以看一下我后面列出来的前两篇参考文献。
（当然，我这里指的「有益」只是文献中的原文「Good viruses」，至于最终定论是否真的是一个「益病毒」，当然还需要更多的实验数据支持和临床案例的研究，还请各位先行了解这一点。）
一、
大家知道肝炎病毒有很多种，最常见的就是甲肝、乙肝、丙肝，但是你听说过「庚肝」吗？也就是庚型肝炎病毒（Hepatitis G Virus，HGV，也称 GBV-C）。
HGV 病毒属于黄病毒科，它的结构与 HCV（丙肝）相似，但是却几乎不引起任何临床症状。HGV 主要是经血传播，而且由于传染途径与 HIV 类似，所以常常会与 HIV、HBV（乙肝）和 HCV 联合感染。
然而有研究报道，合并感染 HGV 的 HIV 感染者中，常表现有 CD4+ 细胞计数升高，故AIDS 病程进展较为缓慢。体外研究也发现，HGV 感染可以降低细胞表面影响 HIV 进入的相关受体的表达，使得 HIV 难以进入细胞；也可以抑制 HIV 病毒的复制；同时，也可以增强固有免疫应答，包括促进 γ- 干扰素的表达等。
另一方面，由于 HGV 还常常与乙肝或者丙肝联合感染，有案例表明，HGV 并不会加重乙肝或者丙肝的临床症状和肝脏酶学变化。在合并感染 HGV 的丙肝（HCV）患者中，有些患者体内的 HCV 病毒血症消失，而且谷丙转氨酶（一个肝功能指标）恢复正常，而同时HGV 的感染却持续存在。
有学者认为，HGV 可能会与这些联合感染的病毒起到一个「竞争」的作用，对人体是无害的，可能是一个「旁观者」的角色，甚至还有可能还起到了「帮助」「有益」的作用。
二、
题主这里问的是病毒，那还请大家不要忘了，噬菌体也是病毒。
我们都知道，我们的粘膜表层是病原体的主要入口点和防御感染的第一线。有研究发现，噬菌体可以粘附在粘膜的粘液上，与人体（或者其它动物宿主）形成「共生」关系，因为这些噬菌体似乎可以帮助消灭入侵粘膜的病原菌。
▲噬菌体粘附在粘液中帮助宿主防御病原菌的模型（参考文献 [3]）
具体来说，在这些噬菌体的衣壳表面有这多变的衣壳蛋白，例如免疫球蛋白样（Ig-like）结构域，而且编码这些结构域的序列占到了有尾 DNA 噬菌体基因组的四分之一。在我们粘膜的粘液中，存在着一种粘液素糖蛋白，它可以为噬菌体的 Ig-like 结构域提供可能的结合位点，从而使得噬菌体可以有效地「共生」在粘膜层，形成实质上的「抗菌层」。
▲从左到右分别为肌病毒科噬菌体、短尾病毒科噬菌体和长尾病毒科噬菌体（Wikipedia）
如此，噬菌体为宿主提供了对潜在病原菌的防御，而宿主也为噬菌体提供了环境和新的寄主。
三、
还有一种的话，是一种叫 γ- 疱疹病毒的病毒。
有研究报道，小鼠感染 γ- 疱疹病毒可以促进对单核细胞增生李斯特氏菌（Listeria monocytogenes）和鼠疫耶尔森菌（Yersinia pestis）的抵抗能力。这里前者是一种人畜共患病原菌，而后者的鼠疫耶尔森菌，就是鼎鼎大名的——鼠疫杆菌，它可是引起过人类历史上三次大流行，死亡人数以千万计。
另外，感染 γ- 疱疹病毒的小鼠也会激活自然杀伤细胞（NK 细胞），可以增加对肿瘤移植物的抵抗能力。
因为人类同样也会感染 γ- 疱疹病毒，因此这种「共生」的关系，以及其所带来的「益处」说不定也会存在于人类之中，但是具体的，还有待于进一步研究。
-
最后其实想说，自然界生物之间的种间关系多种多样，病毒主营寄生是没错，但是在某种程度某些病毒上说不定也可以与宿主互利共生，或者类似于「旁观者」的中性关系，上述便是三个小例子。
想要了解更多，可以参看下面的参考文献。
参考文献
[1] Roossinck M J. Move over, bacteria! Viruses make their mark as mutualistic microbial symbionts[J]. J Virol,2015,89(13):6532-6535.
[2] Roossinck M J. The good viruses: viral mutualistic symbioses[J]. Nat Rev Microbiol,2011,9(2):99-108.
[3] Barr J J, Auro R, Furlan M, et al. Bacteriophage adhering to mucus provide a non-host-derived immunity[J]. Proc Natl Acad Sci U S A,2013,110(26):10771-10776.