官厅水库生物固氮作用对水体富营养化的响应
第41卷第4期吉林大学学报(地球科学版)
V01.41No.4
2011年07月JournalofJilinUniversity(EarthScienceEdition)
July201I
官厅水库生物固氮作用对水体富营养化的响应
孙寓姣,陈
程,丁爱中,程莉蓉
北京师范大学水科学研究院。北京100875
摘要:以官厅水库富营养化水体为研究对象,利用乙炔还原法测量水体生物固氮能力,结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对固氮生物nifH基因进行分析。实验结果表明,官厅水库水体存在生物固氮现象,
固氮速率为0.172~9.35nmol/(ma・d),与水体氨氮、总氮、总磷呈显著相关性(P一0.998,r=0.000;P一
0.986,r=0.000;P=0.968,r一0.002)。DGGE图谱显示:各点固氮细菌丰度差异较大,Shannon—Weaver
指教为0.80~2.45,固氮细茼丰度和总氮、总磷存在较强相关性(P=0.737,,.=0.094;P=0.787,
r=0.063)。随着水体富营养水平的上升,固氮微生物多样性急剧增加,水体固氮能力也随之上升。自然
固氮可能对原本富营养化的水体产生更大危害。
关键词:官厅水库;生物固氮;富营养化;聚合酶链式反应一变性梯度凝胶电泳
中图分类号:
文献标志码:A文章编号:1671—5888(2011)04—1179一07
ResponseofBiologicalNitrogenFixationtoEutrophic
Water
inGuantingReservoir
SUNYu-jiao,CHENCheng,DINGAi-zhong,CHENGLi—rong
Collegeof
WaterSciences,Beijing
Normal
University,BeQing
100875,China
Abstract:In
Guantingreservoir,biologicalnitrogen
fixation
rate(NFR)wasmeasured
with
acetylenereductionmethod,thediversityofnitrogenfixationbacteria(NFB)wasrevealedwithnifH
genePCR—DGGEfingerprint.TheresultsshowedthatbiologicalnitrogenfixationexistsinGuanting
reservoir,the
rates
ofnitrogenfixationrangedfrom0.172
to
9.35nmol/(m3・d).Therewas
a
positive
correlationbetweenNFRand
NH,一N(P---0.998,,.=0.ooo),TN(P一0.986,r一0.ooo),TP(P=
0.968,r一0.002)concentrations,respectively.DGGEfingerprintindicatedthe(NFB)abundancedifferedbetweensixsitesandpositivecorrelationswerefoundbetweenNFBabundanceandTN(P=
0.737,r=0.094),TP(P一0.787,r=0.063).Shannon—Weaver
indexvariedin
a
rangeof0.80—
2.45.Duringtheprocessofeutrophicationinreservior,nitrogenfixationbacteriadiversityincreasedwiththenutrient
status
andtherebyNFRenhanced.Inaddition,biologicalnitrogen
fixationcould
aggravateeutrophicationinGuantingreservoir.
Keywords:Guantingreservoir;biologicalnitrogenfixation;eutrophication;PCR—DGGE
收稿日期:2010—09—08
基金项目:国家自然科学基金项目(50708008)
作者简介:孙寓姣(1975--),女,黑龙江哈尔滨人,副教授,主要从事环境生物技术和污染环境微生物学方面的研究,E.
mail:sunyujiao@bnu.edu.cn
通信作者:丁爱中(1969--).男,安徽怀宁人。教授,博士生导师,主要从事水污染控制、水生态与环境修复研究,E.
mail:ading(孕bnu.edu.an。
万方数据
吉林大学学报(地球科学版)
第41卷
0引言
s4,S5,S6位于水库库区。采样中使用GPS系统对每个采样点进行精确定位,采样点位置见图1。
官厅水库位于北京市西北部,曾是北京市主要
饮用水源地之一。自20世纪80年代以来,官厅水
库水体严重富营养化,并且在夏季会发生严重的铜绿微囊藻水华[1],因而官厅水库于1997年退出北京市饮用水体系∞引。于勇勇“]利用主成分分析法对
官厅水库1990—1999年10个监测断面的水质数
据进行了分析,结果显示,氨氮(NH≯一N)、总氮(TN)、总磷(TP)是官厅水库富营养化的主要贡献因子。近年来,由于北京市饮用水需求量的增加,饮用水短缺问题日益严重,官厅水库的水体修复成为亟待解决的问题之一。水体氮营养元素的来源主要有人为源及天然源,目前针对官厅水库氮素人为来0官厅镇
源的研究很多[5刮,但是对其天然来源的研究则很图1官厅水库采样点圈
少。已有研究表明:生物固氮作用在氮素的自然循Fig.1
Location
ofsamplingsitesinGuantingreservoir
环中扮演着重要角色,它甚至是很多氮限制水体(例如海洋和贫营养湖泊)中氮素的重要来源[7q引。在用有机玻璃采样器采集水深0.5m左右处水一些富营养湖泊中,固氮蓝藻也会成为优势种口’151。
样。用于测定固氮速率的水样注入经盐酸浸泡洗对水体固氮细菌群落结构的研究,是弄清微生净、水样反复润洗的玻璃瓶中,低温条件下避光带回物固氮作用过程的基础。利用传统分离培养方法,实验室;用于基因组DNA提取的水样,注入洗净灭仅能获取环境中不到1%的细菌类群[1引,不利于了菌后的玻璃瓶中低温带回实验室;其它水样用预先解环境微生物的真实存在状况。利用分子生物学手洗净的聚乙烯采样瓶采集,低温带回实验室检测。段进行微生物生态学研究,大大提高了对实际环境1.2水样分析
中微生物多样性的全面认识,聚合酶链式反应
1.2.1
水体固氮速率测定
(polymerasechain
reaction,简称PCR)和变性梯度
水样经过浓缩后,采用乙炔还原法测定水体固凝胶电泳(denaturing
gradientgelelectro-phoresis,
氮速率[18-21]。具体过程如下:取150mL水样经定简称DGGE)技术的联合使用,使得环境微生物分性滤纸过滤除去悬浮颗粒物,再用0.22pm孔径纤子生态学研究向前迈进了一大步。1993年Muzyer维滤膜过滤去除藻类及微生物待用;另取l
500mL
等[17]首次将PCR—i)GGE技术应用于微生物生态水样在8500×g力、4℃条件下离心20min以沉降学研究,并证实了这种技术在研究自然界微生物群藻类及微生物细胞;弃上清液,用150mL经过滤处落遗传多样性和种群差异方面具有明显的优越性。
理的水样重悬浮,即将水样浓缩10倍;取浓缩后的笔者应用乙炔还原法测量官厅水库水体的生物水样50mL,注于65mL磨口三角瓶中,用注射器
固氮能力,同时利用PCR—DGGE技术对官厅水库抽取顶端15%的空气,并注入等量乙炔气体;水样
不同区域水体固氮细菌群落结构变化进行了研究,在27。C培养箱中水浴培养72h,加入0.1
mL
50%
以期发现官厅水库水体固氮微生物固氮能力及其群三氯乙酸(TCA)[z2]后终止反应;取100“L顶端气落结构对富营养化水平的响应。
体,用SP一2100型气相色谱检测乙炔含量,换算成l材料与方法
氮含量表示固氮速率。每个采样点均设置3组平行样,同时用无菌水设置3组对照实验。
1.1水样采集
1.2.2
总DNA提取及固氮nilH基因扩增
水样于2009年7月20日采自官厅水库,采样
水样在无菌条件下经0.22弘m孔径醋酸纤维
时水库库区发生严重水华。共设6个采样点(S1一
素滤膜过滤,生物样品浓缩于滤膜上,滤膜置于S6),其中,Sl,S2,S3位于官厅水库上游妫水河,
--20℃条件下保存。使用OmegaWater
DNAKit
万方数据
第4期孙寓姣,等:官厅水库生物固氮作用对水体富营养化的响应
试剂盒按其操作说明提取水体微生物的总DNA。powerLook
2100XL)。随后使用QuantityOne软
利用1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测结果。
件对DGGE图谱进行分析,分析各泳道条带数目及本研究使用巢式PCR对固氮nifH基因进行扩灰度。nifH基因的多样性使用Shannon-Weaver指增,所用的外引物为FGPHl9和PolR,内引物为
数H[241进行表征。计算公式为
GC—PolF和AQER[23。。PCR反应液含有:1“L已
S
提取的DNA样品,5.0ttL
10X
PCR缓冲液
H=一>:Pf・InPf。
f=l
(Takara公司),4.0“L
2.5
mmol/L.dNTP混合液
式中:P;为每条泳道中第i条条带灰度占该样品总(Takara公司),20mmol/L上下游引物各1“L,
灰度的比率;S为泳道中含有的条带总数目。0.25ttL(0.5
U/ttL)Taq聚合酶(Takara公司),添
1.2.4水体理化参数的测定
加无菌水将反应液补齐至50肚L。PCR扩增条件水温、pH和溶解氧(DO)质量浓度现场测定;为:94℃预变性5min;94℃变性60S,54℃退火60水质理化指标当天送至北京谱尼测试公司测定,包S,72℃延伸2min,共进行30个循环;最后72℃延括p(NH产一N),P(N03一N),P(TN),P(TP),伸7min。使用无菌水替代DNA作为阴性对照。
p(BOD5),p(COD。),p(Fe)等;叶绿素a(Chl—a)质第一轮PCR反应结束后取1弘L产物为模板,量浓度的测定在北京理化测试中心完成。使用内引物进行第二轮扩增。第二轮PCR反应的1.3.5数据处理
反应液与第一轮组成基本一致,只是将第一轮反应所有实验数据均在SPSSfor
Windows(15.o)
体系中5.0弘L的10×PCR缓冲液换成25弘L的2统计软件上进行处理。
×GCPCR缓冲液,添加无菌水将反应液补齐至总2
结果
体系50肛L。第二轮PCR扩增条件为:94℃预变性
5
min;94℃变性60S,56℃退火60S,72℃延伸2
2.1各采样点水质及营养状态
min,共进行30个循环;最后72℃延伸7min。使官厅水库6个采样点主要的理化指标及水质参用无菌水替代第一轮PCR产物作为阴性对照。第数如表1所示。官厅水库夏季表层水温为25.3~二轮产物用1.2%琼脂糖电泳进行检测,用Omega26.3℃,平均pH为8.72,6个采样点p(DO)变化PCR产物纯化试剂盒对PCR条带进行切胶回收。
较大,最大值(7.48rag/L)在S1处测得,最小值
1.2.3
nilH基因扩增片段的DGGE分析
(5.84
mg/L)在S5处测得。水质在妫水河流域和
固氮nifH基因扩增片段通过DGGE分离来研水库库区存在明显差异,库区lD(BODs),JD(COD。,)究固氮微生物多样性。聚丙烯酰胺的变性梯度范围远高于妫水河。氮、磷质量浓度也存在同样的变化为35%~65%,DNA扩增产物上样量约为200
ng,
趋势,库区水体富营养状态比妫水河严重。库区
在60℃恒温、80V恒压条件下,电泳13~15h。电s4一S6的p(Chl—a)严重超标,其中S5处p(Chl—
泳完毕后采用银染技术染色,白光成像(umax
a)高达196mg/m3。
袭1官厅水库采样点水质指标
Table1
Physicaland
chemicalcharacteristicsofsamplingsitesinGuantingreservoir
万方数据
占林大学学报(地球科学版)第41卷
2.2各采样点固氯速率左右,适用于进行DGGE分析。
6个采样点均检测出固氮速率,平均固氮速率
为1.99nmo[/(m3・d),所有对照组均未测得。这
表明.在水华发生的季节官厅水库确实存在生物固氮现象。从图2可知,各采样点固氮速率差异性很大,在富营养水平较高的水库库区,固氮水平较高,其中水华爆发的采样点s5处固氮速率最高,达到
9.35
0.172
nmol/(m3・d);相比之下,固氮速率的最小值nmol/(m3・d)出现在s3处,该处为富营养
化水平较低的妫水河流域。用SPSS软件分析固氮速率和采样点氨氮、总氮、总磷的相关性分别为P一
0.998,r--0.000;P一0.986,r一0.000;P=0.968,r
图3官厅水库各采样点nifH基因PCR扩增图谱
Fig.3
PCR
amplification
of
nifH
gene
in
Guanting
一0.002,表明固氮速率跟三者之间有显著的正相关
性。
reservoir
2.4各采样点固氮细菌DGGE结果
i
86
12,
巢式PCR对固氮nifH基因产生了较好的扩增效果(图3)。产物经DGGE分析后,指纹图谱见图4。泳道中条带数目代表各采样点固氮微生物丰度。由图可见,6个采样点形成了数目不同的条带,且条带的亮度和迁移速率不同,表示官厅水库不同地点固氮微生物丰度差异性大。DGGE图谱中6个采样点分别形成了6,6,3.14,15,8条条带。并且随着水体富营养化程度的加重,条带数量呈逐步增加的趋势,从水质良好的妫水河区域到富营养的水库库
区,nifH基因的DGGE条带数量从3条(S3)增加
“),
s6
1
l
4≤
一..1∞山1\《
二篓
4:
SI
S2
。季
.2一
∞
S4S5
舶
采样点
图2官厅水库采样点水质与固氯速率关系
Fig.2
Correlationbetween
NFRandnutrientstatesin
到15条(s5)。从DGGE条带的亮度变化可以看到,有一种绝对优势固氮在6个采样点中都可以找到,但在富营养化程度严重的水库库区.叉出现了一些新的优势种群。结合表1和图4可看出:随着富营养程度的增加,同氮微生物的种类逐渐增多,在富营养化最严重的s5处.固氮微生物的丰度达到最大值。分析各点固氮微生物丰度和营养物质浓度的相关性,发现固氮物种丰度和总氮浓度的相关性为P
=0.737,r一0.094,总磷的相关性为P一0.787.r一
Guantingreservoir
2.3水样DNA的提取及nifH基因PCR扩增
为了增加DNA的提取效率,在使用试剂盒提取水体DNA样品的过程中增加了机械力细胞破碎的步骤,同时利用反复冻融以及增加水浴温度、时间等方法使水体微生物DNA尽量多地释放出来。提
取出的DNA样品经过lt2%的琼脂糖凝胶电泳检验,片段长度均在23kb左右。使用核酸蛋白测定仪测定产物在260am、280am紫外波长下的吸光
0.063,表明丰度和二者均有一定的正相关性,但总磷对固氮物种丰度的影响更为显著。
用H计算各采样点固氯微生物多样忭结果显
示,H的数值为0.80~24j,表f{爿各采样点固氮微
度,两者比值为1.6~1.8,达到PCR扩增所需条
件。
对提取的DNA进行固氮nifH基因扩增。采取巢式PCR扩增方法,大大提高了扩增的特异性。
经2次PCR扩增后.对最终产物进行切胶纯化回
生物多样性差别较大。最小俩出现在s3处.最大值出现在s5处.表明sj处的固氮微牛物多样性最高。图5足DGGE指纹图潜的聚类分析结果.由图町知:s1.s2.s3三个采样点的Ⅲ氮微生物群落相似性高,s4和s6之间的相似性也很高;『『Iis5点则具有
收,保证了DGGE结果的准确性。用1.2%琼脂糖凝胶电泳检测,扩增出的DNA片段大小为340
bp
万方数据
第4期孙寓妓.等:宵r『水库生物圊氯作用对水体富营养化的响应
独特的群落结构,它和S4、S6的相似性指数为氨氮、硝态氮的条件下,固氮速率较高”。271;此外.0.45,和s1.s2.S3的相似性仅为0.32。
较高的磷浓度,低的氮磷比值,以及水体中铁的存在也能增加生物的固氮速率2””。
和其他贫营养化湖泊比较而吉,官厅水库水体固氮速率相对较低。””。。这是因为在贫营养水体中,氮素是微生物生长的限制因素.生物固氮足水体氮营养的重要来源,而官厅水库氮素严蕈超标.氮元素不是生物生长的限制因素,因此微生物的阎氮作用较小。文献表明,在一砦贫营养的湖泊中,固氮鱼腥藻属容易形成水华以应对水体巾氮素的短缺【“。此情况下,固氮速率的大小和水体氨氮质量浓度一般呈负相关性.冈为氨氮的存在会对l州氮酶
的合成产生抑制作』"。而在本次研究中.官厅水库
6个采样点氨氮对固氮速率并没有明显的抑制作用,而是与水体氨氮质量浓度呈现很强的正相关性;结合DGGE分析结果,营养程度高的采样点固氮微生物种类的大量增加可能是原因之一。另外,固氮
酶的活性中心足由钼铁蛋白组成,因此铁对微生物
同氮行为十分重要_…]。对官厅水库水体铁质量浓
度的测定结果显示,铁离子质量浓度随着固氮速率的增加而减小,最低值(0.026mg/L)出现在固氮速
率最高的S5点处。其原因可能是在固氮速率越大的地点.生物固氮酶合成的速度越高,因此消耗的铁
含量就越多“。
3.2
固氮微生物群落和固氮速率
运用PCR—DGGE技术分析细菌多样性.从而表征环境中微生物的种群比传统培养技术有很大优
闰4官厅水库采样点DGGE指纹图谱
势;虽然DGGE方法只能对微生物群落中数量大干
Fig.4
—
DGGEband
profilesofnifHgeneamplifiedusing
thetotal
genomicDNA
1%的优势种群进行分析“…,且过程中还存在一些不确定因素”。,但是到目前为止.PCR—DGGE技术仍然是研究环境中微生物群落变化的理想工
S5具…。
S6S4对富营养程度不同的水体细菌多样性变化的研S1究很多。”“1,但针对闶氮细菌多样性变化进行的研S3究则较少。冯胜等o“运JfJtPCR—DGGE技术研究S2
太湖细菌群落结构对水体富营养化响应时发现:随圈5官厅水库采样点DGGE图谱聚类分析
着富营养程度的上升.水体细菌的多样性降低,且优Fig.5
UPGMAchusteranalysisoftheDGGEprofil8
势种数日减少;这可能足由于蓝藻爆发产生的藻毒素抑制r某些细菌的生长。在本研究中,利用PCR
3讨论
DGGE技术对官厅水库6个采样点固氮基因多样性分析的结果显示.随着富营养程度的增加.固氮微3.1水环境状况与固氮速率
生物的种类逐渐增多,水体固氮速率也增大。s4.固氮速率受很多因素的影响:一般在低溶氧、低
s5.s6号采样点之问的同氮微生物种类还存在一定
万方数据
1184
吉林大学学报(地球科学版)
第41卷
的差异。聚类分析结果显示,s4和S6号采样点的大学,2006:28—31.
相似度更高,而S5号采样点的群落结构则与s4,S6YUYong-yong.Simulationofwatereutrophicationin号差异很大;由此可以推断富营养程度最高的S5号Guanting
reservoir[D].Beijing:Beijing
NormalUni—
采样点应该具有某些固氮能力更强的固氮微生物,versity,2006
z
28—31.
可以进行更深一步的研究。
[5]WangXT,ChuSG,XuXB.Organochlorinepesti-
cideresiduesin
water
fromGuanting
reservoir
and
4
结论
Yongding
River,China[J].Bull
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1)官厅水库各采样点水质及富营养化程度差异
[6]Zhang
z,HuangJ,YuG,eta1.OccurrenceofPAHs,性大,妫水河流域相对较好,而库区则出现富营养化PCBs
and
organochlorine
pesticidesin
the
Tonghui
现象,发生严重的铜绿微囊藻水华。
Riverof
Beijing,China[J].Environ
Pollut,2004,130
2)官厅水库6个采样点均能检测到生物固氮现(2):249—261.
・
象,固氮速率为0.172~9.35nmol/(m3・d),富营[7]MangalisoJG,StephanieJG.Planktonicnitrogen
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氨氮、总氮、总磷浓度正相关相关系数分别为P=
[8]Joseph
P
M,CarolynMH,ZehrJP.eta1.High
rates
of0.998,r=O.000;P=0.986,,.=0.000;P一0.968,
N2
fixationbyunicellulardiazotrophs
inthe
r=0.002。
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的种类随之增多,同时固氮速率也随之增大,这可能[11]MichaelsAF,OlsonD,SarmientoJL,eta1.In-
会对本已富营养化的水体产生更大的危害。
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官厅水库生物固氮作用对水体富营养化的响应
作者:
作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):
孙寓姣, 陈程, 丁爱中, 程莉蓉, SUN Yu-jiao, CHEN Cheng, DING Ai-zhong, CHENG Li-rong北京师范大学水科学研究院,北京,100875
吉林大学学报(地球科学版)
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