Addgene---2016年最火的慢病毒质粒和腺病毒质粒
2016年七月,Addgene推出了病毒服务,开始为世界各地的科学家提供可立即使用的慢病毒和腺相关病毒(AAV)。最初只有几种有限的产品可以在美国供给,但到了2016年底,Addgene扩大其病毒库存至:25种慢病毒和25种腺病毒。这些病毒被包装成200多个包裹,然后分发到全球20多个国家。在初步的成功后,Addgene将继续提供和扩大这种多样化且有用的工具组合,使世界各地的研究人员可以加快他们的工作。
那么,你是否好奇:到目前为止,全球研究人员发现最有用的是哪种病毒质粒?为此,Addgene对现有的病毒服务进行了数据统计,并找到了2016年最火的慢病毒质粒和腺相关病毒质粒。
TOP慢病毒质粒:
lentiCas9-Blast
Tips
Addgene大部分病毒库存是基于CRISPR工具,虽然我们提供一些非CRISPR相关的包装后病毒。Cas9是大多数CRISPR应用的头条新闻,并且可以在你选择的细胞系转然这种病毒后进行表达。而各种已设计完成的Cas9突变体可以完成独特的编辑任务,如lenticas9-Blast表达的经典Cas9核酸酶,可以介导DNA双链断裂。
Lenticas9-Blast(https://www.addgene.org/52962/)是一个Cas9表达载体,是由Broad Institute 的张锋实验室发表的(Sanjana et al.,2014)。它是一个二元载体系统,即通常需要与一个传递gRNA的第二载体结合使用,例如:lentiGuide-Puro。而单载体系统通常在同一个质粒中表达Cas9和gRNA。lenticas9-Blast病毒可以用来产生Cas9的表达细胞系,可用于筛选(using pooled CRISPR knockout libraries)和个别基因的敲除(using gRNA lentiviruses)。
Cas9的表达有典型的细胞毒性,所以,在得到高滴度的Cas9慢病毒时会遇到困难。当利用lenticas9-Blast产生 Cas9表达细胞时,这种细胞毒性也会导致生长率的变化。为了确保这种生长率的影响不混淆你的实验数据,Addgene建议在进行筛选甚至单基因敲除之前,产生单克隆Cas9表达细胞系。
Top AAV: pAAV-hSyn-DIO-hM4D(Gi)-mCherry
Addgene目前的AAV库存几乎完全来自于北卡罗来纳州大学的Bryan Roth实验室中表达DREADD(Designer Receptors Exclusively Activated by Designer Drugs)的病毒。这些可以用来研究在特定的细胞类型(典型的神经元)中激活特定的信号通路的影响。而这类病毒几乎都很受欢迎,PAAV-hSyn-DIO-hM4D(Gi)-mCherry(https://www.addgene.org/44362/)包含一个融合了mCherry的双floxed人毒蕈碱受体4(Gαi耦合)DREADD,其受人突触蛋白启动子的控制。
当第一次使用这种病毒时,Roth实验室建议使用前先进行Cre重组酶表达的验证。当对固定组织中的hM4D(Gi)-mCherry进行可视化时,实验室还建议使用抗mCherry的抗体而不是内源性的mCherry荧光。
关于本文的更多详细内容,可在Addgene网站上http://blog.addgene.org/top-requested-lentiviruses-and-aav-of-2016查询。