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药物治疗
(1)抗组胺药：主要针对组胺H1受体而发挥治疗作用，效果通常优于肥大细胞稳定剂，特别是在过敏性结膜炎发作时期。抗组胺药通常局部使用，常用的滴眼液有0.1%的依美斯汀(Emedastine)、0.05%的Levocabastine 、0.1% 的
Olopatadine 及0.5%的Ketorolac 。如果有眼外症状，可以口服使用，不过其效果不如局部用药。此外，全身用药还有发生副作用的危险，一些患者可出现胆碱能症状或镇静行为，并有可能引起心律失常。因此，对于从事驾驶、高空作业等工作的患者应特别加以注意。如果在夜间给药，镇静作用往往是有益的，对于小孩尤其如此，因此口服抗组胺药建议最好夜间睡前使用。常用的有苯海拉明、氯苯那敏、异丙嗪等。
抗组胺药与血管收缩剂联合使用，往往可以取得更好的治疗效果。目前已有一些抗组胺药与血管收缩剂的复合制剂，如润洁、那素达等。
(2)肥大细胞稳定剂：肥大细胞稳定剂通过抑制细胞膜钙通道发挥作用。它可以阻止因抗原与肥大细胞膜上IgE 交联而引起的炎症介质的释放。常用的有色甘酸二钠及奈多罗米等。肥大细胞稳定剂的总体治疗效果虽不及抗组胺药，但其对抑制流泪似乎更有效。肥大细胞稳定剂起作用相对较缓慢，对于已经发作的患者治疗效果尤其更差，因此最好在接触过敏原之前使用。肥大细胞稳定剂通常没有明显的毒副作用，如病情需要可以较长时间使用。
(3)非甾体类抗炎药：非甾体类抗炎药是环氧化酶的抑制剂，它可以抑制前列腺素的产生及嗜酸性粒细胞的趋化等，在过敏性疾病发作的急性阶段及间歇阶段均可使用。它对缓解眼痒、结膜充血、流泪等眼部症状及体征均显示出一定的治疗效果。它还可以减少激素的使用剂量。常用的有吲哚美辛(双氯芬酸钠) 、阿司匹林等。口服给药应注意其毒副作用(胃溃疡及出血时间延长等) 。
(4)血管收缩剂：局部使用血管收缩剂(如肾上腺素、萘甲唑林、羟甲唑林、四氢唑林等) 可以抑制肥大细胞及嗜酸性粒细胞脱颗粒，靶细胞释放生物活性物质，从而改善眼部不适，减轻眼表充血，但不宜长期使用。
(5)糖皮质激素：局部使用糖皮质激素具有抑制肥大细胞介质的释放，阻断炎症细胞的趋化性，减少结膜中肥大细胞及嗜酸性粒细胞的数量，抑制磷脂酶A2，从而阻止花生四烯酸及其代谢产物的产生等多种功能。其对迟发性超敏反应亦有良好的抑制作用。
糖皮质激素通常在严重的过敏性结膜炎，使用其他药物治疗无效时才考虑使用，且使用时间不宜太长，以免引起白内障、青光眼、单胞病毒感染、真菌感染及角膜上皮愈合延迟等并发症。常用的有地塞米松、倍他米松及氟米龙等，其中氟米龙引起高眼压发生的几率相对较少。
(6)免疫抑制剂：主要有环孢霉素A 及FK506。对于一些严重的需要使用激素的春季角结膜炎病例，局部应用2%的环孢霉素A 可以很快控制局部炎症及减少激素的使用量。但是，在停药后2～4个月后炎症往往复发。FK506可以抑制
IL-2基因转录及IgE 合成信号传递通路。实验研究发现，在过敏性结膜炎发作前局部应用FK506，可以减轻过敏性结膜炎的发生及抑制肥大细胞脱颗粒。
3. 脱敏治疗 此法主要用于季节性过敏性结膜炎，对于其他亚型的过敏性结膜炎，其治疗效果往往并不理想，因而很少采用。
4. 冷冻疗法 此法主要用于春季角结膜炎冷冻治疗可以导致大量的肥大细胞降解从而使得病情在一段时间内得到平息。冷冻治疗常用于上睑结膜，将温度降至-80℃～-30℃，持续30s 。冷冻治疗可以重复使用2～3次。
5. 心理治疗 眼过敏性疾病是一种急性或慢性的反复发作性疾病，彻底根治常常非常困难。因此，对一些患者造成较大的心理压力。特别是一些春季角结膜炎的患儿，可能会出现一定的心理障碍，应加以注意，必要时应就诊心理医生。
6. 并发症的治疗 遗传性过敏性角结膜炎常常导致结膜纤维化及睑球粘连，这些可以通过黏膜移植及穹隆部再造取得一定的治疗效果。一些春季角结膜炎及异位性角结膜炎可产生严重的角膜并发症而危害视力，必要时可以考虑采用角膜移植进行治疗。