参考文献管理工具
阅读文献是科学研究的一个重要环节。目前有很多文献管理的软件,借助他们,可以很方便的管理文献。各类网络数据库,都提供了文献信息下载的功能。如:在使用IEEE搜索文章的时候,可以点击view selected items,到达Download Citations页面,来下载文献信息。
几个比较有名的文献管理软件有:
Reference Manager, Endnote, Biblioscape, Procite
第一个我们以前一直在用,但是不支持中文。前两个都是很知名的大名鼎鼎的公司出品的,Endnote在后来的新版本中,对中文支持也好一些。
从IEEE可以直接下载的文献格式列表中可以看到Reference Manager, Endnote, 和Procite应该都是比较有影响力的软件。Biblioscape发布得比较晚,据网友评论是最符合我们使用习惯的。它可以按照文件夹的方式来管理,还可以做注解。
Reference Manager和Biblioscape都支持网络发布,对于我们小组来说非常使用。可以把各自搜索的文献,发布到一个统一的数据库中,以后使用的时候,可以直接用IE来访问和使用,非常方便。
近年来,国产有两款软件,也逐渐流行:医学文献王,和NoteExpress。虽然国内软件质量不敢恭维,但毕竟是新出的软件,结合了国外各大软件的优点,也针对国内数据库网站(如中国期刊网)作了针对性的改进,对中文的支持也比较好,所以也值得试用。
我综合比较和试用了各个软件,觉得我们课题组可以采用Biblioscape来统一管理网络数据库。个人可根据自己的特点和需要,在以上推荐的几个软件中做选择。
附上一个详细的介绍和资料。
【Biblioscape】使用Biblioscape的一点体会
我使用Bibioscape已经有1年半了,对于其他的软件我没有使用过,就不妄加评论,只是谈一些使用Biblioscape的体会。
1)因为Bibioscape发展的时间较晚,所以网络数据库中没有提供跟其他软件(如EndNote)一样的导入格式。但是Bibioscape提供了直接将EndNote的格式(*.enw)导入数据库的功能(http://www.biblioscape.com/direct_import.htm),也就是说,凡是提供EndNote格式的数据库,都可以自动导入到Biblioscape中。同时,OVID的CAB提供的文献信息最全面,利用”OVID -- MEDLARS“可以实现将OVID的信息导入到Bibioscape中,我一直都是使用的这种方法。当然,对于国内数据库的题录信息,就需要自己编写Filter了。所以,在导入数据方面Bibioscape是没有任何问题的。
2)从分类管理来看,我比较喜欢Biblioscape。因为,这个软件是按照文件夹分类管理的,符合一般的习惯。并且同一篇文献可以放在不同的文件夹中,便于分类。并且不用担心数据冗余。
3)Biblioscape提供了很多种搜索方式,能够非常方便的找到想要的文献。
4)提供的Attachment功能,能够很方便的管理文献的电子版全文,当数据库移动位置时,也能够保证连接的有效性。
5)集成了BiblioWeb,能够非常方便的与小组内的成员共享自己的数据库,我自己的数据现在已经成为我们小组的公用数据库,为小组成员的工作提供了很多方便。并且BiblioRemote的功能更加强大,但是我还没有应用到实际中。
6)对中文的支持方面,在6.5之前的确存在一些问题,但是,在最近这个问题已经解决了。
7)在与Word的集成方面,Biblioscape不能够很方便的格式化参考文献。如果需要变更格式,必须使用Unformat功能,但是这个功能好像不是太好用。并且,在文章中总是多一些乱码,也不能对中文文献和英文文献分别格式化。但是,Biblioscape提供了比较强大的定制自己的参考文献的格式的功能,能够根据自己的需要定制各种格式。就目前而言,Biblioscape能够解决我在参考文献格式方面遇到的问题。
8)Biblioscape的数据库文件太多,备份不是非常方便。另外据说这个软件目前版本的稳定性比较差,但是,到目前为止,我还没有遇到特别验证的问题。
9)能够比较轻松的找到注册机,对于学生来说,不必担心价格问题。^_^
Biblioscape将在明年元月推出7.0版,据说将在性能和功能上有很大的改进。
上面只是我自己的一些体会,希望能起到抛砖引玉的作用,给大家在选择选择文献管理软件方面提供一些帮助。
Thomson Endnote X v10 (参考书目管理):
EndNote是一款参考书目管理工具,有数以百万计的研究人员、学生和图书管理员使用,它能方便地扩展任何语言参考书目,允许你创建任意大小的文献库。通过EndNote你可搜索在线书目数据库、组织参考书及图片、快速创建参考书目。它兼容下列字处理和文本格式:Microsoft Word 2000, XP, 2003;
WordPerfect, StarOffice, OpenOffice, FrameMaker 富文档格式等。
Introducing EndNote X
EndNote is the industry standard software for organizing references and creating bibliographies. With EndNote X, we are creating a new standard for ease-of-use. And that has millions of students, researchers, writers and librarians worldwide—jumping for joy!
Organize your PDF files with EndNote libraries
EndNote X introduces a new way to manage your PDF files. Now you can drag and drop a PDF file onto an EndNote record saving many steps and creating a link automatically. The PDF files are stored along with the EndNote references. And when you need to move your EndNote library between computers, the new compressed library option creates a single-file backup for easy transport.
View more—or less—detail as desired
EndNote X expands your library view with up to eight fields enabling you to sort columns quickly. A new icon identifies references containing links to PDF and other files. The reference edit window now includes a show/hide empty fields option to reduce scrolling for reference detail.
Other new features:
Reference type lists are now alphabetized for locating easily
Four new reference types—Grant, Ancient Text, Dictionary, and Encyclopedia The "Electronic Source" references type is renamed to "Web Page."
New—compressed library option creates a single-file backup for moving EndNote libraries between computers Store up to 45 links per reference in the "Link to PDF" field Convert existing PDF links to the new EndNote-relative link in one step
Use the PDF icon in the EndNote toolbar to open the first linked file in the highlighted reference "Change Text" and "Change Fields" include a new option for tab and carriage returns used in phrases
Search fields and words using "begins with" and "ends with"—replaces "Use Full Text Index" of previous versions "RTF Document Scan" is renamed to "Format Paper" Search and collect references in new ways
EndNote X offers new search options including “begins with” and “ends with” for field and word searching. With continued suggestions from users, EndNote X includes new and updated files for searching online resources, importing references, and formatting bibliographies. You’ll find 800+ connections to online sources, 540+ import filters and over 2,300 publishing styles!
【转贴】参考文献管理软件切身谈
一、开场白
参考文献管理,是研究者永恒的困扰。
这种困扰,主要来自三个方面:
1,文献知识管理。当文献知识积累到一定程度,仅仅靠自己的大脑记忆,很苦,也很不可靠。
2,参考文献引述。写作时,文中注释,文后参考文献,都需要大量引述。逐一录入也是苦不堪言。
3,文献管理。常规纸质书籍,多到一定程度,就不太好找。以辄止而言,就把这种事看作体力劳动。电子文献多了,也有类似问题。
于是,参考文献管理软件,应运而生。
辄止七、八年前,看到日本学者使用这种软件,即艳羡不已。这两年也试着在用,有付出,也有收获。这里谈的就是一些切身体会。
应该先行说明的是,目前这类软件,主要是给生物、医药学界编制的。国内一个比较有名的软件,名字就叫“医学文献王”。而讨论这类软件最多的地方,也是著名的生物医学论坛——丁香园。辄止不得已,与这些高智商的同胞,厮混了好久。甚至亲手操刀,汉化过两种主要的英文软件。以至有些生物学家、医学家——当然也可能是未来的即研究生,称辄止为医生、大夫。辄止又曾积极参加国产软件NoteExpress的测试,呼吁“为文科用户着想”,因而很荣幸成为第一批获准免费使用该软件的人选。虽然,以后的介绍会以NoteExpress为主,但这主要是由于软件本身的特性,与许可免费使用一事无关。
二、Endnote与Biblioscape
这是两个外国品牌。一两年之前在中国,这两个软件几乎就是参考文献管理软件的代名词。近期国产软件崛起,其影响才略微衰减。这种状况,老外并不大清楚。前不久,在波士顿大学国际考古中心同老美偶然谈起Endnote,他们竟很惊奇中国人对这个软件的熟悉。
Endnote和Biblioscape的基本功能,应该说都差不多。即可以检索那些生物、医学专业数据库,导入数据(国产数据库只有通过一些间接的方法导入或者自己录入),并在WORD中导出数据。配合Styles,可设定各种期刊的投稿模式及相应的参考文献格式,并且有分析文献的 功能。另外还支持题录与全文的链接,能够在需要时调用全文。其详细用法,不烦赘述。有兴趣的谈友可以查看一些详细的介绍。如果想用汉化版,也可向辄止要汉化补丁。辄止作这些补丁,一方面是E文不行,在E文界面常常犯晕。另一方面也是为了在丁香园挣点工分。
这两个软件的区别,有一点非常明显。就是Endnote是将所有题录放在一个数据库中。如果想作不同专题的题录,需要建立不同的数据库。Biblioscape则可在一个库下,对题录分类、分层管理,非常符合研究之需。辄止在试用之后,第一感觉是后者更适合自己的需要。
不过,在进一步使用之后,发现Biblioscape有一个致命的问题,就是对中文支持不好。通常以为,Biblioscape对中文的支持比Endnote,其实不然。Endnote在7.0以前,对中文不支持。近年升级频繁,8.0、9.0对中文支持越来越好。Biblioscape升级极慢,6.5版从今年3月至今,未见升级。以辄止的经验,这个最高版本(6.5)在中文的支持上,比Endnote8、9明显要差。这里不妨试举二例:在作者排序时,裘姓(这可是辄止常常引述到的一个姓呵)、邴姓不能按拼音正确排序。有的人名最后一字在格式化时,也会出错。比如:
X海--X萧
X剑--X绘
辄止给程序编制者去信,方知这是因为软件不支持unicode而引发的。据云,这类问题需要到version8解决。可现在还是6.5,什么时候才能升级到8.0呢?真是“俟河之清,人寿几何”。
在比较之后,辄止清楚这些大牌软件,对自己并不合适。
三、医学文献王
作为国产文献管理软件,医学文献王是最早取得成功的。软件开发商北京金叶天翔科技有限公司自诩“国内第一款(参考文献)管理软件”,似非虚言。它比较普及的版本是1.3,最新版本已是2.0。
文献王综合了Endnote、Biblioscape二者的特长,中文界面,并且在数据获取和输出格式上实行本土化,因而赢得不少医学从业人员的喜爱。
其特点可归纳为以下三点:
1,数据分类、分层管理。用户可自行添加或删除数据文件夹,可以在不同文件夹之间实现数据的移动。这显然是借鉴了Biblioscape的作法。
2,用户可方便地将检索到的数据导入。这里特别应该说到的,是在检索CNKI(中国期刊网)的时间,可以通过点击鼠标右键,将检索到的数据轻易导入。当然,这样导入的数据,对医学、生物专业人员来说,还不够详细,所以出现一些用户自己编辑的导入滤器。但对于历史专业的人士而言,已经足够了。 3,可以比较方便地与Endnote、Biblioscape软件交换数据。
不过,文献王也有令人头痛的地方。
首先,其运行较慢,与WORD兼容似乎有些问题。据说,新版本已经有大改善。不过,辄止还没有试用,不好妄言。
其次,它的输出格式只有尾注一种,无法用于脚注。辄止想象这是撰写医学文献的规则,但对文科用户而言,这却是一个致命伤。因为我们固然有时用尾注,但更多的时候需要用脚注。当然,人家本来就是“医学文献王”,是辄止自己好事要去招惹它。
看到这种情形,辄止不多加思索,便放弃了长期使用文献王的打算,转而将眼光投向国产文献管理软件中的黑马——NoteExpress。
关于NE的介绍,辄止拜托wedfast007兄来作。wedfast007兄不象辄止那样不求甚解,相信会谈得更好。 对于NoteExpress,我还处于浅尝阶段。由于之前对于文献管理软件缺乏使用体会,所以无法将它与其它同类软件进行横向对比,因此也只能就软件本身来谈软件。
下面是该软件的功能介绍
NoteExpress是北京爱琴海软件公司(http://www.AegeanSoftware.net)开发的一款专业级别的文献检索与管理系统,其核心功能涵盖“知识采集,管理,应用,挖掘”的知识管理的所有环节,是学术研究,知识管理的必备工具,发表论文的好帮手。产品主页地址:http://www.SciNote.com
NoteExpress具备文献信息检索与下载功能,可以用来管理参考文献的题录,以附件方式管理参考文献全文或者任何格式的文件,文档。数据挖掘的功能可以帮助用户快速了解某研究方向的最新进展,各方观点等。除了管理以上显性的知识外,类似日记,科研心得,论文草稿等瞬间产生的隐性知识也可以通过NoteExpress的笔记功能纪录,并且可以与参考文献的题录联系起来。在编辑器(比如MS Word)中NoteExprss可以按照各种期刊杂志的要求自动完成参考文献引用的格式化-------完美的格式,精准的引用将大大增加论文被采用的几率。与笔记以及附件功能的结合,全文检索,数据挖掘等,使该软件可以作为强大的个人知识管理系统。
NoteExpress的主要功能可以列举如下:
1 题录采集
1)从互联网上数以千计的国内外电子图书馆,文献数据库中检索,下载文献书目信息,软件内置多线程,是同类软件中下载速度最快的。以后将提供用户自己添加,管理这些连接的功能。
2)可以从全球最大的在线书店Amazon的资料库中检索,下载题录信息。
3)从硬盘本地文件中导入用户以前搜集的各种的文献资料题录,速度比国外同类软件快10倍以上(参考文献的全文可以通过附件管理)。
4)手工添加。
2 题录管理:
1)检索方便,检索结果可以保存下来作为一个研究方向专题。
2)数据库容易携带,备份。
3 题录使用:
1)快速检索和浏览,以了解研究方向的最新进展。
2)NoteExpress的核心功能之一就是在学术论文、专著或研究报告等的正文中,按照国际通行惯例,国家制定的各种规范,期刊杂志要求的各自的规范(可由用户自己编辑规则),在正文中的指定位置添加相应的参考文献注释或说明,进而根据文中所添加的注释,按照一定的输出格式(可由用户自己选择),自动生成所
使用的参考文献、资料或书目的索引,添加到作者所指定的位置(通常是章节末尾或者文末)。目前在同类软件中,NoteExpress的word插件的性能最好。
4 笔记功能:
可以为正在阅读的题录添加笔记,并把笔记和题录通过链接关联起来,方便以后阅读。
5 任意格式的附件和文献全文,电子书管理:
题录,笔记与附件功能结合,可以把该软件作为个人的知识管理系统。参考文献的全文也是作为题录或者笔记的附件来保存。
四、NoteExpress的数据添加
谢谢wedfast007兄讲解NoteExpress的基本操作。辄止技痒,想谈得更具体一点。因有此文。 NoteExpress(暱称NE)数据添加,是最基本的操作。
这大致有三种办法。
第一,手工录入 这是最无奈的作法。在References中选定或添加需要的目录,然后在题录框点鼠标右键,新建题录。选择题录类型,再按需要逐项填写。以辄止体会而言,作为初用者,这里有几点需要注意。一是题录类型要准确,如“期刊文章”、“书”、“学位论文”等等。辄止颇感不便的是没有“电子文档”一类,以收录如“简帛”、“简帛研究”等网站的文章。只好用“通用”代替。二是所有题录类型的字段都没有月份、日子。在处理书籍时,想加入月份数据;处理网站文章时,想加入月、日,都没有现成的位置。辄止无奈,只好以“日期”字段充用。相应地,网站文章网站名也没有现成的地方填写,辄止是放在“期刊”中。网文详细地址倒是有“链接”现成的字段。如果大家不反对的话,以后作简帛的朋友是不是也参照辄止这个选项。只有一致,今后才能方便地交换数据哦。
一条数据录入之后,点按上端三个按钮中的中间一个,保存并退出。如果再要录入下一条,循环进行就行了。
第二,从数据库中检索导入 对作简帛、作中国古代史的朋友而言,有三个数据库常常用到。一是CNKI即中国期刊网(最时髦的叫什么”知网’),二是北京大学,三是北图联合编目中心。
先说CNKI。目前开发者推荐的,是先在CNKI中检索,批量选中所欲添加的题录,保存题录,另存为文本文件,再用开发者提供的 Filter导入。或者在保存题录后,全选,拷贝,再在导入题录中选择“来自剪贴板”,导入即可。需要注意的是,CNKI的版本很多,只有使用相应的 Filter才能正确导入。这方面,可以到http://www.scinote.com/supportcn/cgi-bin/topic_show.cgi?id=168&h=1&bpg=1&age=0下载视频来看。 其实还有一种比较简易的方法。就是先用医学文献王,用其鼠标右键的保存功能,将保存下来的题录导入至文献王,再导出,再导入至NE。这实际上涉及到第三个方法了。
北大、北图的数据,是关于图书的。可以批量检索、导入。比如可以拿“简牍”、“楚简”、“秦简”或者某位学者名作关键词,检索起来,结果一批一批的。辄止还用“中华书局”、“文物出版社”作关键词,命中的书目更多。不过,这种检索总是有问题,有些常见书也可能出不来。要当心哦。
第三,从别的文献管理程序中转入 如果自己或朋友有现成的数据,就可以免掉很多麻烦。如果也是NE的数据,可以直接打开,再作其他处理。如果是其他软件,NE作好了对应的Filter,只要正确地导出、导入,就可以了。
五、NoteExpress的题录引用
应该补充说明一下,题录就是我们通常所说的文献。因为这不是文献本身,而是文献的标题及相关信息,NE开发者叫它题录,也许更恰当。
我们大家作题录库,一个心照不宣的意图,是为了在写作时,能即时插入需要的题录。而不要到那时才一一翻检并且逐个输入。
在NE中设计中,题录插入主要是靠Word插件完成。虽然这个功能对我们这个行当来说,基本上是个无用的累赘,但还是介绍一下为好——不然开发者可能会感到委屈。
NoteExpress正确安装,重新启动word后的NoteExpress工具栏如下图所示:
通过NoteExpress菜单“菜单--->选项 --->Word 插件”,也可以启用或者停用这个插件——建议在对这个工具栏感到心烦时立即执行“停用 ”。
点击NoteExpress的References(题录)文件夹或其子文件夹,选中题录列表中的一条或多条题录(reference)——这个选择也可以通过搜索实现,尤其当题录太多时——回到Word窗口,在文档需要插入题录信息的位置,点击工具栏上的“插入引文”。
点击工具栏上的“格式化参考文献”按钮,在出现的“格式”窗体中选择要使用的输出样式,点“确定”按钮,完成引文格式化。
如果需要撤消“格式化参考文献”的结果,点击“引文及参考文献去格式化”按钮。
如果引入论文中的某些参考文献信息的格式化已经完成,而不想被再次改变,可以先在文中选中之,然后点击“清除所有域代码”按钮。清除所有域代码后,再点击“格式化参考文献”或 “引文及参考文献去除格式化”时,对本篇文章中该文献信息不再产生影响。
辄止不得不说明的是,这个功能看上去很美,实际上用处并不大。因为它所产生的题录,只有尾注一种——辄止更愿意把它看作文末的参考文献,而不能用作脚注。
如果不是因为有另外一种补充,辄止也会象舍弃文献王那样立即舍弃NE——谁愿意花费精力伺候一个精美的废物呢?
这个补充方法,是NE的“格式化拷贝”。当我们选中所欲插入的题录后,按鼠标右键—格式化拷贝(嘻嘻,这个功能是应辄止建议而作的哟),再转到WORD文档的插入点粘贴,一条题录就插入了。这样的插入位置是可以自己随意选择的,当然我们会比较多地用于脚注或尾注。
如果有朋友在这时已经用NE在尝试,也许会说:这个格式不是我所需要的。没关系,下回辄止会具体地介绍格式处理。
六、NoteExpress输出样式编辑
在引述题录时,样式(Style)很重要。通过工具—输出样式—选择输出样式,将需要的题录输出样式确定下来,才能使文档中的引述题录符合投稿对方的要求。
不同的刊物、出版社,对注释的要求往往有异。NE大概会通过逐渐积累,建立国内外一些常见刊物对文献征引的样式。不过,在目前阶段,用户自建样式是不可避免的。今后NE输出样式多起来,也不可能包罗万象,有时还是会要自己动手。
编辑输出样式,其实比较简单。通过工具—输出样式—输出样式管理器,可以自由地改造或创建样式。下面先说创建。
点击新建,进入样式编辑器,选择参考文献—模板。点击“题录类型”按钮,选择适合的类型,如通用、期刊文章、书。这时编辑框中出现相应以“通用”、“期刊文章”或者“书”为名的编辑条。然后多次点击“插入字段”按钮,在需要的位置选择字段,如“作者”、“期刊”、“标题”、“年份”、“期”等等,并在其间按需要输入标点、插入分隔符(目前版本分隔符有问题,开发者已承诺改进),然后保存。保存时会提示文件名,输入你所定义的期刊或样式名即可。
改造是利用现有样式来作的。在管理器中选择一个与需要近似的模板,对其加以改造,以符合自己的需要。这样会简单一些。但辄止发现这样作会有一点麻烦,即采用这样作出的样式引用题录时,会出现多余的段落标记,需要一一删去。
在同行之中,样式往往相同。因此,朋友之间可以把作好的样式交换。最直接的方法,是在样式目录(NoteExpress/Styles)将其拷贝出来,放到对方这一目录,再在样式管理器中按“刷新”,这个样式即可显示出来,并为你所用。
NE中许多场合不能即时更新,而是需要手动刷新,这应该说是不便之处。以后大概会改进。