荧光定量RT-PCR步骤
荧光定量real-time PCR反应步骤
一、RNA 的抽提(捷瑞试剂盒GK3011)
准备:
1. 95%乙醇184ml+ DEPC水至250ml (70%),擦拭台面(量筒、250ml 瓶DEPC 处理)
2. 配置2ml 氯仿/异戊醇(960ul ﹕40ul )2管,20次
3. 配置RPE Solution液,RPE/无水乙醇(180ul ﹕720ul )10管,20次
4. 恒温加热器调整到65℃
提取:
1. 细胞(10)消化离心,转移至1.5mlEppendorf 管内,离心,去上清
2.1mlHanks 液稀释、吹散,取25ul 细胞计数(约10/L)结果乘以0.01即细胞量,其余细胞离心,去上清,加入0.5mlTrizol
3.1ml 注射器抽吸,裂解细胞后,加入100ul 氯仿/异戊醇,剧烈震荡混匀30sec ,12000rpm ,5min
4. 上清液转移到另一Eppendorf 管内加入150ul 无水乙醇混匀
5. 将全部溶液(包括沉淀)转移到套放于2ml 收集管内的GenClean 柱内,室温放置2min ,12000rpm ,1min
6. 取出柱子弃去废液,再将柱子放回收集管内加入450ulRPEsolution ,12000rpm ,30sec ,并重复一次
7. 取出柱子弃去废液,再将柱子放回收集管内10000rpm ,30sec
8. 取出柱子,放入Eppendorf 管内,柱内膜中心加入40ulDEPC-H 2O (包装盒内的),65℃,2min
9.12000rpm ,1min ,管内即为RNA 样品,-70℃保存。 96
*10细胞约可提RNA100ug
*1OD260=40mg RNA,浓度=(OD 260-OD 320)×稀释倍数×0.04ug/ul
*RNA的分析定量:测定在260和280nm 的OD 值(TE Buffer稀释),OD 260/280=1.8~2.0视为提取的RNA 纯度很高,小则蛋白质污染,大则RNA 被水解。
*肌肉细胞的trizol 使用量应该加大
二、RT 反应
1. 在microtube 管内加入如下反应液(冰上)
2.65℃ 5min, 冰上急冷(﹥1min )
3. 再向管内加入如下反应液(冰上)
4. 逆转录反应
1.30℃10min (用Random 6 mers时,用Olig dT省去此步),2.42℃(到50℃之间)45min ,3.70℃15min ,4. 降温到4℃ 6