水分子团簇分子力场方法的比较研究
物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)
October[Article]
ActaPhys.-Chim.Sin.,2007,23(10):1565-15711565
www.whxb.pku.edu.cn
水分子团簇分子力场方法的比较研究
张
3
强1,2,*
121000;
2
杨忠志3
复旦大学生命科学学院,上海
(1渤海大学化学化工学院,辽宁锦州200433;
辽宁师范大学化学化工学院,辽宁大连116029)
摘要:采用传统水分子力场模型(SPC,TIPnP(n=3-5))和极化模型(POL3,DANG,AMOEBA,SPC-FQ,TIP4P-
FQ)对水分子二聚体团簇性质进行了比较和研究.以从头计算和实验数据为依据,分析水分子在外场作用下体系
的静电极化、电荷转移和分子结构变化.通过水分子二聚体结合能和各分解能量项评价极化静电势能在双分子结合能中的地位和作用,以及各水分子力场的适用性.通过水分子团簇多体相互作用能的计算,展示不同极化水分子力场定量计算极化能量的实际能力.通过对力场模型结果的对比和分析,为进一步发展极化力场模型,并应用到其他体系提供借鉴和依据.
关键词:水分子;力场;团簇;静电极化
中图分类号:O641
AComparativeStudyofWaterClustersbyClassicaland
PolarizableWaterModels
ZHANGQiang1,2,*
YANGZhong-Zhi3
(1InstituteofChemistryandChemicalEngineering,BohaiUniversity,Jinzhou121000,LiaoningProvince,P.R.China;2
CollegeofLifeSciences,FudanUniversity,Shanghai200433,P.R.China;3InstituteofChemistryandChemicalEngineering,
LiaoningNormalUniversity,Dalian116029,LiaoningProvince,P.R.China)
Abstract:Severalclassicalwatermodels(SPC,TIPnP(n=3-5))andpolarizablewatermodels(POL3,DANG,AMOEBA,SPC-FQ,TIP4P-FQ),combiningtheresultsofabinitiomethodswereemployedtostudythepropertiesofwaterclusters,suchasstructures,dipoles,induceddipoles,chargetransfer,polarizedenergies,many-bodyenergiesandbindingenergies,andwereevaluatedagainsttherelatedliteratureworks.Whetherthepolarizedeffectcouldbeneglectedinthemodelngofwaterclusters,itwasjudgedbythetotalpotentialandthedecomposedenergyterms.Allinall,thepolarizablewatermodels,especiallytheinducedmultiplemodel(AMOEBA),dobetterjobthanclassicalfixedchargemodels.Fluctuatingchargeandfoursitesmodelaremorerealistictobeappliedtothebiologicalsytemsinconsiderationofthebalanceofefficiencyandaccuracy.Thecomparablestudiesofthispaperprovideareferencefordevelopingthepolarizedmodelsandapplyingthemtoothersystems.KeyWords:
Watermolecule;Forcefield;Cluster;Electrostaticpolarization
研究和发展模拟生物大分子体系的分子力场方法,一直是理论与计算化学领域的重要研究内容[1].水分子在生物体系中无处不在,对生物分子结构和功能都起着至关重要的作用,所以高质量的水分子
力场是模拟生物分子环境的基础.目前,应用于生物体系模拟的水分子力场模型包括SPC和TIPnP(n=
3-7)系列[2-5],从简单的三原子位点到包含化学键和孤对电子的七点模型,从刚体(rigidbody)到非刚体
Received:April2,2007;Revised:May17,2007;PublishedonWeb:June28,2007.*
Correspondingauthor.Email:zhangqiang@fudan.edu.cn;Tel:+8621-55664151.国家自然科学基金(20633050)和博士后科学基金(20070410689资助项目
!EditorialofficeofActaPhysico-ChimicaSinica
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行了初步的研究,与传统的两体势场模型相比,更接近实验结果,得到许多双体模型不能获取的光谱信息等.但是,极化力场模型目前主要局限于水分子体系的研究,而且对水分子团簇的结构研究一般限于平衡稳定结构,对非平衡结构的水分子团簇性质,尤其是静电极化作用的具体研究和表述较少[7].因此,本文利用目前发展的水分子力场模型SPC、TIP3P、TIP4P、
作用位点不同,如SPC/L模型vdw相互作用位点不仅仅包括氧原子,同时也作用在氢原子上;(2)电荷位点数目变化,如TIP4P和TIP5P模型增加了非原子中心位点;(3)模型参数改变,如增加各位点的电荷量,改变键长和键角的大小等;(4)水分子是否视为刚性分子,即键长和键角的值是否恒定.总体上讲,双体势场模型在向多位点非刚性方向发展.
考虑静电极化作用是目前发展的主要方向.极化力场模型分为三种,第一种是诱导点偶极模型[8-10],如Pol模型.其在简单水模型方程(1)的基础上,又加入了点偶极极化势能项,一般在氧离子上设立一个极化位点i,氢原子仍采用固定电荷,极化位点的极化率参数为",诱导偶极!#i通过方程(2)得到,极化位点的静电场Ei通过方程(3)得到,Til表示偶极相互作用张量.
!
!
TIP5P、AMOEBA、POL3、DANG、SPC-FQ和TIP4P-
分子FQ方法,编写程序,模拟水分子二聚体的结构、
间相互作用势能、诱导偶极和诱导电荷等信息,分析和比较各模型的合理性和特点.通过水分子团簇多体能的计算,探讨极化诱导作用在水分子团簇势场中的重要性,比较不同极化模型模拟极化势场的能力.
1力场模型和方法
常见的简单水分子力场模型分为简单点电荷力
#i="Ei
!
j≠i
l≠i
!
(2)
场[2](simplepointcharge,SPC)和可转移的分子间势能函数[3-5](transferableintermolecularpotential,TIP-
!33!
・#l)/rilEi=-#(rijqj)/rji-#(Til
!!!!!2
(rji=ri-rj,Til=1-3rilril/ril)
(3)
nP),基本采用刚体水分子结构,即固定键长和键角.
水分子间的势场通过范德华(vdw)相互作用和静电
四点相互作用来描述.静电相互作用位点分为三点、
和五点模型,具体结构如图1所示,水分子力场的一般方程形式为,
j)-C6(i,j)(1)U(rij)=qiqj+C12(i,0ijijijqj为原子i、j的电荷参数,!0为真空介电常数,rijqi、
一般为原子i、j间距离,C6和C12是vdw吸引和排斥势能项参数.方程(1)等号右边第一项为固定电荷静电势能项,第二和第三项为范德华排斥和吸引势
能项.模型间也存在一定区别:(1)模型中水分子势场
极化力场的第二种为浮动电荷模型[11-15].该模型利用电负性均衡(EEM)和力场方法相结合,构造水分子势场,如Rick和Berne等人建立的SPC-FQ和
TIP4P-FQ(fluctuatingcharge)浮动电荷刚体水分子力场[11],在模拟过程中通过EEM方法计算电荷,用Lennard-Jones势计算不同水分子中氧原子和氧原子之间的vdw相互作用.含有Nmol个分子,每个分子有Natom个原子的体系热能可表示为方程(4)形式:
1J0Q2]+$0U[(Q),(r)]=##[Ep(0)+~pQip+ppipi=1p=1
Nmol
Natom
#J
ip<jq
pq
(ripjq)QipQjq+#V(ripjq)
ip<jq
(4)
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张
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势能U为体系中原子的电荷Q和位置r的函数.其
0
中~!0p和Jpp是依赖于原子类型的价态电负性和价态
水分子团簇中的作用,展示不同极化力场模型描述水分子团簇体系的实际情况.部分从头计算数据利用密度泛函BLYP交换相关势和aug-cc-pVDZ基组下计算得到,文献[21,22]表明以上方法和基组适合水分子团簇性质的计算,与实验数据符合很好.文中实验和其他理论计算数据来源于文献报道.
硬度.Ep(0)是原子p的基态能量,Jpq(ripjq)是Coulomb相互作用,V(ripjq)是分子i中的p原子和分子j中的
q原子之间的非Coulomb相互作用.在电荷守恒条件下,利用EEM方法计算体系中各电荷位点随外
势变化的点电荷,从而得到极化静电相互作用势.方程(4)中的最后一项为vdw相互作用项.
第三种为Drude模型[16].该模型把诱导偶极!"i表现为一个无质量虚电荷位点(Drude位点)-qvi,通过一个假想弹簧与原子位点!ri相连,其电荷为+qvi,连接
!v
两个位点的向量!ri由极化位点的极化率#决定,大小和方向由方程(5)表示,E(!ri)表示在位点i处的电场.该方法在动力学模拟计算效率上较诱导点偶极模型(自洽方法)有显著提高.
!
!!v
"i=qvi!ri=#iE(ri)
!
!
2结果与讨论
模拟中的各水分子模型参数列于表1中,水分
子实验O—H键长为0.09472nm,H—O—H键角为
104.52°,从结构上看,SPC[2]、POL3[8]、SPC-FQ[11]模型
的键长和键角都相同,略大于实验值,TIP4P[4]、TIP4P-
FQ[11,12]模型都在H—O—H键角平分线上距离O原
子0.015nm处设立了无质量电荷位点,TIP5P模型[5]则在O原子的孤对电子方向加入了两个无质量虚电荷位点.ABEEM-TIP7P模型[14,15]又加入了化学键电荷位点,AMOEBA为多极极化模型[10],多极参数未在表中列举,表中前四种为非极化模型,以上模型的具体细节可参考相应文献.
(5)
另外,诱导偶极和浮动电荷相结合模型已对多肽构象和静电极化作用进行了初步的探讨[17,18],但是由于计算量较大,进一步应用受到限制.目前也在发展高效算法[19,20]来提高计算速度,使极化模型能够真正应用到生物大分子体系.
本文采用的水分子力场模型包括SPC、TIP3P、
2.1力场方法下水分子二聚体的性质比较当水分子在外场作用下,分子的结构和静电性
质将发生改变,传统的固定电荷水分子力场采用平均势场近似,不能正确反应极化作用.我们就利用水分子的二聚体(Cs对称性,图2)作为主要的研究对象,来讨论水分子间的静电极化作用.利用从头计算方法(BLYP//aug-cc-pVDZ)和9种力场模型计算了水分子二聚体以氧原子之间距离为变量的双分子势能(ER)曲线,如图3所示.
各水分子力场的势能曲线形状基本都与从头计
TIP4P、TIP5P、AMOEBA、POL3、SPC-FQ和TIP4P-FQ等,其中前5种为非极化模型,AMOEBA模型为非刚体诱导多极(quadruplemoment)模型,POL3为诱导偶极模型,SPC-FQ和TIP4P-FQ为浮动电荷极化模型,未包含Drude模型.利用自编Fortran程序包,模拟水分子团簇二聚体的结构和性质.结合实验和从头计算结果,进行了对比和研究,分析静电极化在
表1
水分子力场模型参数
l2/nm
q10.410.4170
0.0150.0700.0215
0.520.24100.3650.5190.25983
0.015
0.63
q2-0.82-0.8340-1.04-0.2410-0.730-1.038-0.51966-1.26
-1
Table1
ModelSPCa[2]TIP3PTIP4P
a[3]c[4]
Theparametersofwaterforcefieldmodels
l1/nm0.10000.095720.095720.095720.10000.095720.095720.10000.09572
#O/#H
θ/(°)109.47104.52104.52104.52
0.528/0.171.4440.837/0.496
109.47104.5108.50109.47104.52
σ/nm0.31660.3150610.3153650.3120.35960.32340.34050.31760.3159
・ε/(kJmol-1)
0.65270.6360.64850.66940.69040.76570.46021.23011.2008
TIP5Pd[5]POL3a[8]DANG
c[9]
AMOEBAa[10]SPC-FQa[11]TIP4P-FQ
c[12]
・InAMOEBAmodelthehydrogenvdwsiteisadded.Theparametervaluesof$and%are0.2655nmand0.06499kJmol,respectively.
Superscriptsa,c,ddenotethestructuresinFig.1.$and%areLennard-Jonesparameters,theseparationanddepthofthepotentialenergyminimum
betweentwosimilarmolecules(equivalenttodiameter);l1,l2aretheO—Hbondlengthandtheseparationbetweenoxygenatomandthelonepairsitesinwatermolecule;q1,q2denotethepartialchargesofoxygenatomandhydrogenatom;#O,#Haretheatomic
polarizabiltiesofoxygenandhydrogenatom;&isthebondangleofwatermolecule.
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固定电荷势场给出的势能曲线趋势与从头计算符合更好.将分子间相互作用能分解为库仑势能项Ec和范德华势能项Ev,库仑项由极化项Ep和非极化项两部分组成,非极化势场中没有前者Ep,分解后各势能项的曲线如图4所示,从分解后的曲线中不难发现,在氢键距离较大时极化势能项对总势能Et的贡献较小,而在距离较小时,Ep有明显的上升,在Et中的比重显著增加,为了防止近核区域的静电极化塌
图2
水分子二聚体结构
Fig.2Thestructuresofwaterdimers
陷,极化势场模型增大了范德华排斥势能,在其参数值要远大于固定电荷表中我们发现其极化势场的ε
模型,同时在极化模型中通常采用了屏蔽库仑势,使近核区域分子键作用势能更加合理,如AMOEBA模型的近核区域曲线相对其他极化模型梯度平缓.
气态水分子二聚体平衡结构数据列于表2中,极化力场模型给出的水分子间氢键键长与从头计算和实验结果符合较好,固定电荷势场为了能够较好模拟单分子偶极和水溶液的介电常数等物理性质,减小了氢键的距离,从而得到合理液态水的汽化焓
表2
气态水分子二聚体平衡结构氧原子间距离、
氢键的键角和结合能
图3
水分子二聚体势能ER曲线
Fig.3ThepotentialERcurvesofthewaterdimer
Table2
算量子势场一致,固定电荷力场模型的势能陷较深,在大于平衡距离部分都给出了低于从头计算的结果,其中TIP5P、SPC和TIP3P给出的平衡构型相互・作用势能都在-27.2kJmol以下,远远低于气态二聚体从头计算给出的能量-19.3kJ・mol-1,极化模型对应的曲线与从头计算符合更好,其中TIP4P-FQ模型结果最好.其原因为,定电荷力场未加入极化作用,缺少极化静电势能项,为了能较好地模拟水溶液体系的极化环境(实验平均值为-22.6kJ・mol-1),所以不同程度上加大了电荷参数,导致了计算气态水分子二聚体的相互作用能误差较大.在小于平衡核间距曲线部分,极化势场的势能有更大的上升梯度,而
-1
Thehydrogenbondlength,bondangle,and
bindingenergyofwaterdimer
R(O…O)/nm
θ)a/(°58±660.257.2056.1750.0050.0057.3659.0452.45
#d/(°)0±65.72.463.911.64-1.362.625.270.19
・U/(kJmol-1)
Expt.abinitioSPCTIP3PTIP4PTIP5PPOL3AMOEBATIP4P-FQ
0.2980.29390.2750.2750.2740.2680.2790.28920.292
-22.6-18.0-27.7-27.2-26.4-28.4-19.6-20.8-18.8
"adenotestheacuteanglebetweenthevectorofH—O—Hangular
bisectorofacceptorwaterandtheO…Odirectionvectorofwaterdimmer;#ddenotestheacuteanglebetweentheO…OdirectionvectorandtheO—H(donorhydrogenatom)bondvectorofdonorwater.
图4
水分子二聚体各能量项随R(O…O)的变化曲线
Fig.4Thedecomposedpotentialenergycurvesofthewaterdimmer
Et,Ec,Ev,andEparethetotalpotentialenergy,theelectrostaticpotential,thevdwpotential,and
thepolarizedelectrostaticpotentialofwaterdimmer,respectively.
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等热力学性质,极化势场能够合理反映外势场的影响,通过诱导静电势来合理体现环境场的变化,因而在气态和凝固态下都能很好体现水分子体系的结构和热力学性质.在表2中也同时发现,极化势场下的水分子二聚体的平衡结构参数(如在图2中定义的!a和"d角)较固定电荷势场模型接近从头计算和实验值.另外,我们发现当增加水分子的电荷位点,如TIP5P模型,加入了孤对电子电荷位点,对水分子二聚体的结构和气态结合能都没有根本改善,文献报道有效电荷位点的增加对模拟水溶液的热力学和动力学性质有明显改善[7].
加入极化项的目的是体现分子在外场下合理体现静电极化性质和体系电子密度变化,为了进一步对比和分析不同极化模型的表现,计算了二聚体在不同的氢键距离时的体系偶极矩和诱导偶极矩(如图5所示),以及在TIP4P-FQ和SPC-FQ浮动电荷模型下,极化位点的电荷变化情况(如图6所示).从结果比较发现,AMOEBA模型在大于氢键平衡距离时体系的偶极矩低于从头计算结果,而在平衡距离以内时表现了相反的结果,其他的极化模型的偶极矩变化趋势与从头计算结果基本相符,但是偶极矩明显
图6
浮动电荷模型下负电荷位点电荷随氧氧间距离变化曲线
Fig.6
Partialchargecurvesofthenegativechargesiteforthefluctuatingchargemodelwith
theoxygen-oxygendistance
高于从头计算结果,尤其在平衡距离之外的部分.以上结果的主要原因是AMOEBA采用电场的高级展开项(四极势场),虽然计算量增加,但是能够更合理地体现体系势场.另一方面由于不同模型的结构参数不同(如键长、键角),造成了二聚体偶极在平衡距离之外明显偏高.诱导偶极矩的变化除了POL3模型外都与从头计算的结果符合较好,尤其是
AMOEBA和SPC-FQ模型,POL3模型表现的诱导作用偏低,表明POL3模型的参数还不够和谐,极化度偏低,有待进一步改善和优化.浮动电荷极化力场不但可以计算偶极矩变化,而且能够体现分子内的电荷密度变化和电荷转移.从图6和图7的TIP4P-FQ模型下水分子负电荷虚位点和SPC-FQ的氧原子负电荷位点变化曲线,以及与从头计算(HF/6-31G(d,p)Mulliken电荷分布)氧原子电荷的线性相关曲线中发现,两者的电荷变化梯度与从头计算相符,两者的线性相关系数都达到了0.98以上,证明模型参数合理,能够定量体现体系的电荷密度变化.
以上结果说明,固定电荷力场不能很好地描述气态水分子二聚体的分子间静电势,极化模型基本能够体现分子间的静电极化或电荷转移,AMOEBA多极模型表现更好,但计算量较大,力场的结构和非键参数直接影响体系性质,应进一步优化力场参数.2.2三体能
多体能是研究多分子体系多体极化的重要参数[21].水分子多聚体的总能量En可以写成多个分子
1,2,3,4…n的加和,正如,
图5
水分子二聚体偶极变化曲线(a)和诱导偶极变化曲线(b)
Fig.5
Dipolemomentcurves(a)andinduceddipolemomentcurves(b)ofthewaterdimmer
En=E(1,2,3,4…n)≡"E(i)+""!2E(ij)+
i=1
i=1
j>i
nn-1n
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图7浮动电荷水模型下负电荷位点极化电荷与从头计算极化电荷线性相关曲线
Fig.7
Thelinearrelationshipcurvesbetweenthepolarizedpartialchargesofthefluctuatingcharge
modelandabinitioatnegativechargesites
n-3
n-2
n-1
n
!!!!E(ijk)+!!!!!E(ijkl)+…+
3
4
i=1
j>i
k>j
i=1
j>i
k>j
l>k
n-2n-1n
HF/6-31G**为主,所以出现这样的误差也是正常的,TIP4P-FQ模型应依据更精确量子化学方法进一步提高参数质量.以从头计算MP2/aug-cc-pVDZ结果为例,三体能在总势能中的比例达到了14%,在离子溶液中的极化能将会更高,那么加入极化势能项对模拟水溶液的结构和性质至关重要.2.3(H2O)3-20水分子团簇结构
利用多种力场模型对(H2O)3-20水分子团簇结构进行了模拟,水分子团簇结构数据列于表4中.R(O…O)为形成氢键的水分子间氧原子距离,!d,"a和"d分别
为形成氢键的O—O…H键角,氢键受体水分子
(6)
式中E(i)是水分子孤立气态单分子能量,E(ij)、E(ijk)分别是水分子多聚体中两分子(i,j),三分子(i,j,k)等的相互作用能,对于三水分子体系的三体能可利用(7)式计算,其三体能可以写成:
!3E(ijk)=E(ijk)-{E(i)+E(j)+E(k)}-
{!2E(ij)+!2E(ik)+!2E(jk)}(7)
其中,
!2E(ij)=E(ij)-{E(i)+E(j)}!2E(ik)=E(ik)-{E(i)+E(k)}!2E(jk)=E(jk)-{E(j)+E(k)}
根据以上计算方案,利用三种极化力场模型分别计算水分子三聚体的三体能,在表3中列举了各
能量项的结果.与从头计算MP2/aug-cc-pVDZ结果相比(含Relaxation能量项)[21],AMOEBA模型的结果误差最小,TIP4P-FQ模型的结果略差,但其与
!nE(1234…n)
H—O—H键角平分线与O…O连线所成锐角和氢键供体水分子H—O—H键角平分线与O…O连线所成锐角,以从头计算HF/6-31G(d,p)[23]结果作为参照,比较力场模型结果.文献[21,23]结果表明HF/6-31G(d,p)方法下R(O…O)较实验结果和MP2/aug-cc-pVDZ
表4
HF//aug-cc-pVDZ基本一致,其主要原因可解释为,由于AMOEBA模型参数的拟合主要是根据从头计算MP2//aug-cc-pVDZ方法得到,采用的方法精确度较高,而TIP4P-FQ模型发展较早,参数拟合主要以
表3
水分子三聚体三体能(kJ・mol-1)
(H2O)3-20水分子团簇中形成氢键的水分子间氧原子距
离R(O…O)平均值和!d,"a,"d相对从头计算的均方根偏差Table4Themeanoxygen-oxygendistanceofthewatersforminghydrogenbondR(O…O)andtheRMSDof!d,"a,"dcomparingtoabinitiodatafor
(H2O)3-20waterclusters
ModelSPCTIP3PTIP4PTIP5PPOL3AMOEBATIP4P-FQ
R(O…O)/nm0.28080.27870.27570.27380.28140.28040.2834
χ)d/(°8.798.408.408.3912.157.357.69
θ)a/(°5.525.552.1710.025.651.112.98
θ)d/(°1.581.560.523.632.110.551.17
"ddenotestheacuteanglebetweenthevectorofH—O—Hangular
Table3Thethree-bodypotentialenergy
mol-1)ofthewatertrimer(kJ・
ModelPOL3TIP4P-FQAMOEBAHF/aug-cc-pVDZMP2/aug-cc-pVDZ
-E1219.7915.8617.9115.1021.09
-E1319.7515.8617.9514.9820.92
-E2319.2915.4016.1113.8119.41
-E12365.5652.5564.1048.8369.29
-Ethree-body6.745.4412.135.489.50
bisectorofdonorwaterandtheO…Odirectionvectorofwaterdimmer.
No.10
张
强等:水分子团簇分子力场方法的比较研究
chemistry.NewYork:Wiley-VCH,1999:183-2472
1571
略偏大,总体结构与实验结果基本相符.极化模型下的氢键键长较从头计算略小,可能更接近实验数据,与测定的O…O径向分布函数的第一峰位相符,非极化模型下的氢键长度过短,所以非极化力
[24]
Robinson,G.W.;Zhu,S.B.;Singh,S.;Evans,M.W.Waterinbiology,chemistryandphysics:Experimentaloverviewsandcomputationalmethodologies.Singapore:WorldScientific,1996
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场不适合于气态水分子团簇氢键模拟.从各模型下
!d,"a和"d角度相对从头计算的均方根偏差数据中发现,AMOEBA多极模型下的结构与从头计算的
结果符合最好,其次为TIP4P和TIP4P-FQ模型,从模型的位点分布分析,四位点模型势场下的团簇结构更加合理,这一点在溶液体系的模拟中也有充分体现[4,11].简单的三位点模型结果也相对合理,而且计算量较小.总体上.四点模型和加入多极展开项都对合理模拟水分子团簇及溶液结构有重要作用.
10Ren,P.;Ponder,J.W.J.Phys.Chem.B,2003,107:593311Rick,S.W.;Stuart,S.J.;Berne,B.J.J.Chem.Phys.,1994,101:
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3结论
本文通过对气态水分子二聚体相关性质的计算,详细比较了不同水分子力场模型下的结果,重点考察了极化力场模型对静电极化影响的定量描述,得出如下结论:(1)固定电荷力场不能很好地描述气态水分子二聚体的分子间静电势,电荷位点的增加对气态水团簇的能量性质没有改善;(2)力场的结构和非键参数直接影响体系性质,如偶极矩,氢键键角等力场参数应进一步优化,四点模型相对合理;(3)极化模型能够在一定程度上体现分子间的静电极化或电荷转移,改善了水分子二聚体结构模型,
AMOEBA多极模型效果更好;(4)从极化力场模型特点和结果分析,浮动电荷模型计算量较小,准确度相对较高,更符合大分子体系模拟的需要.
References
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