保护碱基表
PCR 设计引物时酶切位点的保护碱基表 1 关键词： PCR 设计引物时酶切位点的保护
不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求 不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求 切割率% 酶 Acc I 寡核苷酸序列 2 hr
GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG 0 0 0 0 >90 >90 >90 >90 >90 50 >90 >90 10 >90 >90 0 75 25 0 0 50 0 0 25 25 0 0 >90 50
20 hr
0 0 0 0 >90 >90 >90 >90 >90 >90 >90 >90 25 >90 >90 0 >90 >90 0 0 >90 10 0 50 >90 0 0 >90 50
Afl III
CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG
Asc I
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
Ava I
CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
BamH I
CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG
Bgl II
CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC
BssH II
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
BstE II BstX I
GGGT(A/T)ACCC AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
Cla I
CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG
EcoR I
GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG
>90 >90 >90 >90 >90 >90 0 0 10 0 >90 >90 0 25 0 50 0 0 0 0 75 75 0 10 10
>90 >90 >90 >90 >90 >90 0 0 75 0 >90 >90 0 50 0 75 0 0 0 0 >90 >90 0 25 50
Hae III
GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA
Hind III
CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG
Kpn I
GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG
Mlu I Nco I Nde I
GACGCGTC CGACGCGTCG CCCATGGG CATGCCATGGCATG CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC
Nhe I
GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG
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酶切位点保护碱基表 2 关键词： 酶切位点保护碱基表 2
切割率% 酶 寡核苷酸序列 2 hr 20 hr
Not I
TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
0 10 10 25 25 10 >90 0 0 0 0 0 0 75 0 10 >90 >90 0 0 10 0 10 0 50 0 10 10
0 10 10 90 >90 >90 >90 0 25 >90 0 25 50 >90 0 10 >90 >90 0 0 25 10 10 0 >90 0 50 75
Nsi I Pac I
TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG
Pme I
GTTTAAAC GGTTTAAACC GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
Pst I
GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
Pvu I
CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA
Sac I Sac II Sal I
CGAGCTCG GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCG G ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCG GAA
Sca I Sma I
GAGTACTC AAAAGTACTTTT CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
10 75 0 0 10 >90
25 75 10 10 50 >90
Spe I
GACTAGTC GGACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG
10 10 0 0 0 0 10 >90 >90 >90 0 >90 75 75 0 10 10 0 25 50 >90
>90 >90 50 50 0 25 50 >90 >90 >90 0 >90 >90 >90 0 25 75 0 75 >90 >90
Sph I
GGCATGCC CATGCATGCATG ACATGCATGCATGT
Stu I
AAGGCCTT GAAGGCCTTC AAAAGGCCTTTT
Xba I
CTCTAGAG GCTCTAGAGC TGCTCTAGAGCA CTAGTCTAGACTAG
Xho I
CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG
Xma I
CCCCGGGG CCCCCGGGGG CCCCCCGGGGGG TCCCCCCGGGGGGA