核酸电泳相关试剂.缓冲液的配制方法
核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法
50×TAE Buffer (pH8.5)
组份浓度 2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于1 L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加入57.1 ml的乙酸,充分搅拌。
4. 加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×TBE Buffer (pH8.3)
组份浓度 890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer
组份浓度 200 rnM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法
1. 称41.8 g MOPS,置于1 L烧杯中。
2. 加约700 ml DEPC处理水,搅拌溶解。 3. 使用2 N NaOH调节pH 值至7.0。 4. 再向溶液中加入下列试剂。
5. 用DEPC 处理水将溶液定容至1 L。 6. 用0.45 m滤膜过滤除去杂质。 7. 室温避光保存。
注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。
溴乙锭 (10 mg/ml)
组份浓度 10 mg/ml溴乙锭 配制量 100 ml 配制方法
1. 称量1 g溴乙锭,加入到100 ml容器中。
2. 加入去离子水100 ml,充分搅拌数h 完全溶解溴乙锭。 3. 将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。 4. 溴乙锭的工作浓度为0.5 g/ml。
注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。
Agarose 凝胶 配制方法
1. 配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE 或1×TAE) 。 2. 根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。 3. 加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量) 。 注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。
4. 在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中加热熔化琼脂
糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。小心摇动锥形瓶。使琼脂糖充分均匀熔化。此操作重复数次,直至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波
炉中加热时间不宜过长,每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。
5. 使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓度0.5 µg/ml)。
并充分混匀。
注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。
6. 将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度 一般在
3~5 min之间。
7. 在室温下使胶凝固(大约30 min~1 h),然后放置于电泳槽中进行电泳。
注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存,一 般可保存2~5天。
琼脂糖凝胶浓度与线形DNA 的最佳分辨范围
6 × Loading Buffer(DNA电泳用) 组份浓度
配制量 500 ml 配制方法
1. 称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
2. 向烧杯中加入约200 ml的去离子水后,加热搅拌充分溶解。 3. 加入180 ml的甘油(Glycerol)后,使用2 N NaOH调节pH 值至7.0。 4. 用去离子水定容至500 ml后,室温保存。
10 × Loading Buffer (RNA电泳用) 组份浓度
配制置 10 ml 配制方法
1. 称量下列试剂,置于10 ml离心管中。
2. 向离心管中加入约4 ml的DEPC 处理水后,充分搅拌溶解。 3. 加入5 ml的甘油(Glycerol)后,充分混匀。 4. 用DEPC 处理水定容至10 ml后,室温保存。
核酸、蛋白质杂交用相关试剂、缓冲液的配制方法
20×SSC
组份浓度 3.0 M NaCl,0.3 M Na3citrate·2H2O(柠檬酸钠) 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 滴加14 N HCl,调节pH 值至7.0后,加去离子水将溶液定容至1 L。 4. 高温高压灭菌后,室温保存。
20×SSPE Buffer
组份浓度 3.0 M NaCl,0.2 M NaH2PO4,0.02 M EDTA 配制量 1.L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加NaOH 调节pH 值至7.4(约6.5 ml的10 N NaOH)。 4. 加去离子水将溶液定容至l L。 5. 高温高压灭菌后,室温保存。
50 X Denhardt’S溶液 组份浓度
配制量 500 ml 配制方法
1. 称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
2. 加去离子水约400 ml,充分搅拌溶解 3. 加去离子水将溶液定容至500 ml。
4. 用0.45µm 滤膜过滤后,分装成每份25 ml。 5. -20℃保存。
0.5 M磷酸盐Buffer
组份浓度 0.5 M Na2HPO4。 配制量 l L 配制方法
1. 称量134 g Na2HPO4·7H2O 置于l L烧杯中。 2. 加入约800 ml的去离子水充分搅拌溶解。 3. 加入85%的H3PO4(浓磷酸) 调节溶液pH 值至7.2。 4. 加去离子水定容至1 L。 5. 高温高压灭菌后,室温保存。
Salmon DNA (鲑鱼精DNA) 组份浓度 10 mg/ml Salmon DNA 配制量 约100 ml 配制方法
1. 称取鲑鱼精DNA 2 g置于500 ml烧杯中,加入约200 ml的TE Buffer。 2. 用磁力搅拌器室温搅拌2~4 h,溶解后加入4 ml的5 M NaCl,使其终浓度为
0.1 M。
3. 用苯酚和苯酚/氯仿各抽提1次。
4. 回收水相溶液后,使用17号皮下注射针头快速吸打溶液约20次,以 切断
DNA 。
5. 加入2倍体积的预冷乙醇进行乙醇沉淀。
6. 离心回收DNA 后,溶解于100 ml的去离子水中。测定溶液的OD260值。 7. 计算溶液的DNA 浓度后,稀释DNA 溶液至10 mg/ml。 8. 煮沸10min 后,分装成小份(1 ml/份) 。-20℃保存。 9. 使用前在沸水浴中加热5min 后,迅速冰浴冷却。
DNA 变性缓冲液
组份浓度 1.5 M NaCl,0.5 M NaOH 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
预杂交液/杂交液 (DNA杂交用) 组份浓度
配制置 100 ml 配制方法
1. 称量下列试剂,置于200 ml烧杯中。
2. 充分混匀后,使用0.45 µm 滤膜滤去杂质后使用。
预杂交液/杂交液(RNA杂交用) 组份浓度
配制量 100 mL 配制方法
1. 称量下列试剂,置于200 ml烧杯中。
2. 充分混匀后,使用0.45µm 滤膜滤去杂质后使用。
膜转移缓冲液(Western杂交用)
组份浓度 39 mM Glycine,48 mM Tris,0.037%(W/V)SDS,20%(V/V)甲醇 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约600 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加去离子水将溶液定溶至800 ml后,加入200 ml的甲醇。 4. 室温保存。
TBST Buffer(Western杂交膜清洗液)
组份浓度 20 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,0.05%(V/V)Tween 20 配制量 1 L 配制方法
1. 称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加入0.5 ml Tween 20后充分混匀。 4. 加去离子水将溶液定容至l L后,4℃保存。
封闭缓冲液(Western杂交用)
组份浓度 5%(W/V)脱脂奶粉/TBST Buffer 配制量 100 ml 配制方法
1. 称5 g脱脂奶粉加入到100 ml TBST Buffer中,充分搅拌溶解。 2. 2.4℃保存待用(本封闭液应该现配现用) 。
实验室常用培养基的配制方法
Ampicillin(氨卡青霉素)(100 mg/ml) 组份浓度 100 mg/ml Ampicillin 配制量 50 ml 配制方法
1. 称量5 g Ampicillin置于50 ml离心管中。
2. 加入40 ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50 ml。
3. 用0.22 µm 过滤膜过滤除菌。 4. 小份分装(1 ml/份) 后,-20℃保存。
IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)(24 mg/ml) 组份浓度 24 mg/mL IPTG 配制量 50 mL 配制方法
1. 称1.2 g IPTG置于50 ml离心管中。
2. 加入40 ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50 ml。 3. 用0 22 µm 过滤膜过滤除菌。 4. 4小份分装(1 ml,份) 后,-20℃保存。
X-Gal (20 mg/ml)
组份浓度 20 mg/ml X-Gal 配制量 50 ml 配制方法
1. 称量l g X-Gal置于50 ml离心管中。
2. 加入40 ml DMF(二甲基甲酰胺) ,充分混合溶解后,定容至50 ml。 3. 小份分装(1 ml/份) 后,-20℃避光保存。
LB 培养基
组份浓度 1%(W/V)Tryptone(胰蛋白胨) ,0.5%(W/V)Yeast Extract(酵母提取物) ,1%(W/V)NaCl 配制量 1 L 配制方法
1. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 滴加5 N NaOH(约0.2 m1),调节pH 值至7.0。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L。 5. 5高温高压灭菌后,4。C 保存。
LB/Amp培养基 组份浓度
配制量 1 L
配制方法
1. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 滴加5 N NaOH(约0.2 mL)。调节pH 值至7.0。 4.
加去离子水将培养基定容至1 L。 5. 高温高压灭菌后,冷却至室温。
6. 加入1 ml Ampicillin(100 mg/ml)后均匀混合。 7. 4℃保存。
TB 培养基 组份浓度
配制量 1 L 配制方法
1. 配制磷酸盐缓;中液(0.17 M KH2PO4,0.72 M K2HPO4)100 ml。
溶解2.31 g KH2PO4和l2.54 g K2HPO4于90 ml的去离子水中,搅拌溶解 去离子水定容至100 ml,高温高压灭菌。 2. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
3. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L后,高温高压灭菌。
5. 待溶液冷却至60℃以下时,;加入100 ml的上述灭菌磷酸盐缓冲液。6. 4℃保存。
TB/Amp培养基 组份浓度
配制量 1 L 配制方法
后,加
1. 配制磷酸盐缓冲液(0.17 M KH2PO4,0.72 M K2HPO4)100 ml。
溶解2.31 g KH2PO4,和12.54g K2HPO4于90 ml的去离子水中,搅拌溶解后,加去离子水定容至100 ml,高温高压灭菌。 2. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
3. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 4. 加去离子水将培养基定容至l L后,高温高压灭菌。
5. 待溶液冷却至60℃以下时, 加入100 ml的上述灭菌磷酸盐缓冲液。 6. 均匀混合后4℃保存。
SOB 培养基 组份浓度
配制量 1 L 配制方法
1. 配制250 mM KCl溶液。
在90 ml的去离子水中溶解l.86 g KCl后,定容至100 ml。
2. 配制2 M MgCl2溶液。
在90 ml去离子水中溶解19 g MgCl2后,定容至100 ml,高温高压灭菌。 3. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
4. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 5. 量取10 m1 250 mM KCl溶液,加入到烧杯中。 6. 滴加5 N NaOH溶液(约0.2 m1),调节pH 值至7.0。 7. 加入去离子水将培养基定容至l L。 8. 高温高压灭菌后,4℃保存。
9. 使用前加入5 ml灭菌的2 M MgCl2溶液。
SOC 培养基 组份浓度
配制量 100 mL 配制方法
1. 配制l M Glucose溶液。
将18 g Glucose溶于90 ml去离子水中,充分溶解后定容至100 ml。用0.22 滤膜过滤除菌。
2. 向l 00 ml SOB培养基中加入除菌的1 M Glucose溶液2 ml,均匀混合。3. 4℃保存。
2×YT 培养基
组份浓度 1.6%(WV)Tryptone,1%(W/V)Yeast Extract,0.5%(W/V)NaCl 配制量 1 L 配制方法
1. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
µm
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 滴加5 N NaOH,调节pH 值至7.0。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L。 5. 高温高压灭菌后,4℃保存。
Фb×broth
组份浓度 2%(W/V)Tryptone,0.5%(W/V)Yeast Extract,o 5%(W/V)MgSO4·7H2O 配制量 1 L 配制方法
1. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 滴加1 N KOH。调节pH 值至7.5。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L。 5. 高温高压灭菌后,4℃保存。
NZCYM 培养基 组份浓度
配制量 1 L
配制方法
1. 称取下列试剂。置于l L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 滴加5 N NaOH(约0.2 m1),调节pH 值至7.0。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L。 5. 高温高压灭菌后,4℃保存。
NZYM 培养基 组份浓度
配制方法
NZYM 培养基除不含Casamino Acid外,其他成份与 NZCYM 培养基相同。 NZM 培养基 组份浓度
配制方法:NZM 培养基除不含Yeast Extract(酵母提取物) 外,其他成份与NZYM 培养基相同。 一般固体培养基的配制
配制方法
1. 1. 按照液体培养基配方准备好液体培养基,在高温高压灭菌前,加入下列
试剂中的一种。
2. 高温高压灭菌后,戴上手套取出培养基,摇动容器使琼脂或琼脂糖充分混匀(此
时培养基温度很高,小心烫伤) 。
3. 待培养基冷却至50~60℃时,加入热不稳定物质(如抗生素等) ,摇动容器充分
混匀。
4. 铺制平板(30~35 ml培养基/90 mm培养皿) 。
LB/Amp/X-Gal/LPTG平板培养基 组份浓度
配制量 1 L 配制方法
1. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 滴加5 N NaOH(约0.2 mL),调节pH 值至7.0。 4. 加去离子水将培养基定容至1 L后,加入15 g Agar。 5. 高温高压灭菌后,冷却至60℃左右。
6. 加入1 ml Ampicillin(100 mg/ml)、1 ml IPTG(24 mg/ml)、2 ml X-Gal(20 mg/mL)
后均匀混合。
7. 铺制平板(30~35 ml培养基/90 mm培养皿) 。 8. 8.4℃避光保存。
TB/Amp/X-Gal/LPTG平板培养基 组份浓度
配制量 1 L 配制方法
1. 配制磷酸盐缓冲液(0.17 M KH2PO4,0.72 M K2HPO4)100 ml。
溶解2.31 g KH2PO4和12.54 g K2HPO4于90 ml的去离子水中,搅拌溶解后,加去离子水定容至100 ml,高温高压灭菌。 2. 称取下列试剂,置于l L烧杯中。
3. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
4. 加去离子水将培养基定容至1 L后。加入l 5 g Agar。 5. 高温高压灭菌后,冷却至60℃左右。
6. 加入100 ml 的上述灭菌磷酸盐缓冲液、l ml Ampicillin (100mg/ml)、1 ml
IPTG(24mg/mL)、2 ml X-Gal(20 mg/ml)后均匀混合。 7. 铺制平板(30~35 ml培养基/90 mm培养皿) 。 8. 4℃避光保存。
抗生素的贮存溶液及其工作浓度
*1以水为溶剂的抗生素贮存液应通过0.22 µm 滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应保存于不透光的容器中。
*2镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB 培养基) 。
SDS-PAGE 浓缩胶(5%Acrylamide)配方表
SDS-PAGE 分离胶配方表