农业部科技发展中心主要开展农业科技管理
农业部科技发展中心主要开展农业科技管理、植物新品种保护、农业转基因生物安全、农村能源与生态环境建设、农业标准化与农产品质量安全管理等工作，为部科技教育司和市场信息司提供技术支撑和服务。
中国绿色食品发展中心的主要职能是：受农业部委托，制定绿色食品发展方针、政策及规划，组织制定和推行绿色食品的各类标准；依据标准，认证绿色食品；依据《农产品质量安全法》、《中华人民共和国商标法》，实施绿色食品产品质量监督和标志商标管理；组织开展绿色食品科研、示范、技术推广、培训、信息交流与合作等工作；指导各省市区绿色食品管理机构的工作；组织、协调绿色食品产地环境和产品质量监测工作。
农业部优质农产品开发服务中心主要职责：
1、受农业部委托承担优质农产品开发思路及布局规划的研究，组织协调、指导地方优质农产品开发和技术服务工作；
2、承办种植业产品质量标准、技术规程的信息收集、技术分析、专家论证、标准草拟工作；
3、推广优质农产品生产、加工、储运技术；
4、组织协调优质农产品资源开发和市场推介工作；
5、引进、试验、示范和开发国外名、特、优、新品种；
6、承担优质农产品信息网络建设，开展信息咨询服务；
7、承担无公害种植业产品的认证工作；
8、归口管理有关挂靠协会；
9、承办农业部交办的其他事项。
全国农业技术推广服务中心成立于1995年，是农业部直属事业单位，下设23个处（室），主要负责全国农作物栽培、土壤改良、科学施肥、旱作节水农业、有害生物防治、农药安全使用等重大技术以及优良品种的引进、试验、示范与推广；承担全国农业植物检疫管理，国家农作物品种区域试验与审定，以及种子市场监督工作；组织全国农作物有害生物发生动态和农田墒情与旱情监测预报；承担全国种子、土壤、肥料质量监督检验工作；指导全国种植业技术推广体系建设和职业技能鉴定工作；承担种植业有关重大项目实施、信息发布与行业标准制（修）订工作；负责组织种植业技术推广国际合作与交流项目的实施；指导挂靠社团组织的业务工作。
农业部农产品质量安全中心于2002年12月经中央机构编制委员会批准成立,为农业部直属正局级事业单位。主要职能是：贯彻执行国家关于农产品质量安全管理及认证等方面的政策、法律、法规和规章制度；组织实施无公害农产品认证及产地认定工作；负责农产品地理标志登记保护审查、专家评审和对外公示工作；组织制定无公害农产品和农产品地理标志登记管理技术规范；监督管理无公害农产品标志和农产品地理标志公共标识；委托管理无公害农产品和农产品地理标志定点检测机构及标志印制单位；对口指导地方各级农产品质量安全工作机构、无公害农产品工作机构和农产品地理标志登记保护工作机构工作；负责无公害农产品检查员、农产品地理标志核查员培训注册和管理工作；组织开展农产品质量安
全方面的信息交流和国际合作；组织实施无公害农产品和农产品地理标志证后产品质量安全监督管理和执法检查，组织开展无公害农产品和地理标志农产品包装与标识监督检查；配合有关部门实施农产品质量安全执法监督管理工作；完成农业部交办的其他工作。