粪菌移植综述
文献综述 REVIEW
粪菌移植: 公元4世纪至2013年
崔伯塔, 王 敏, 季国忠, 范志宁, 张发明
■背景资料
崔伯塔, 王敏, 季国忠, 范志宁, 张发明, 南京医科大学第二人离不开肠道菌附属医院消化医学中心 南京医科大学消化内镜研究所 江苏群而存在, 但是人省南京市 210011
类对其认知尚少. 崔伯塔, 医师, 主要从事炎症性肠病的研究.
粪菌移植(f e c a l 作者贡献分布: 本文综述由崔伯塔与王敏完成; 季国忠、范志宁microbiota trans-及张发明负责审校.
plantation, FMT) 通讯作者: 张发明, 副教授, 硕士生导师, 210011, 江苏省南京市近年引起全世界姜家园121号, 南京医科大学第二附属医院消化医学中心, 南京的关注并挽救了医科大学消化内镜研究所. [email protected]数以万计的生命. 电话: 025-58509883
发展标准化FMT 收稿日期: 2013-07-12 修回日期: 2013-07-25
是本领域的重要接受日期: 2013-09-09 在线出版日期: 2013-10-28
任务.
Fecal microbiota
transplantation: from the 4th century to 2013
Bo-Ta Cui, Min Wang, Guo-Zhong Ji, Zhi-Ning Fan, Fa-Ming Zhang
Bo-Ta Cui, Min Wang, Guo-Zhong Ji, Zhi-Ning Fan, Fa-Ming Zhang,Center for Digestive Diseases, the Second Affiliated Hospi Institute of Digestive Endoscopy & Medical tal of Nanjing Medical University, Nanjing 210011, Jiangsu -Province, China
Correspondence Institute of Digestive Endoscopy & Medical Center for Di-to: Fa-Ming Zhang, Associate Professor, gestive Diseases, the Second Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, 121 Jiangjiayuan, Nanjing 210011, Ji-angsu Province, China. [email protected]:Accepted: 2013-07-12 2013-09-09 Revised:Published online: 2013-07-25
2013-10-28
Abstract
Intestinal namic microbiota has been result human organ. Many diseases defined occur as a as dy -Human of which fecal the disorder microbiota of a transplantation intestinal microbiota. (FMT), 4th was originally reported in China in the since century, has become popular in recent years, ment it rent of shows pseudomembranous an amazing effect colitis in and the recur-treat-not only been proposed as a first-line treatment Clostridium difficile infection (CDI). It has for recurrent CDI but also been utilized to treat inflammatory syndrome, bowel disease, ■同行评议者
fatigue 刘占举, 教授, 同therapeutic syndrome. metabolic The syndrome, irritable mechanism and bowel behind chronic the 济大学附属上海most 市第十人民医院
can use widely effects the whole accepted of FMT intestinal hypothesis is still unclear. microbiota is that The from FMT a
世界华人消化杂志 2013年10月28日; 21(30): 3222-3229
ISSN 1009-3079 (print) ISSN 2219-2859 (online)
healthy donor to replace the patient’s disordered gut beginning stage, and there is an urgent need to microbiota. At present, FMT is still in the develop safety past, present and future of FMT by introducing analysis. standardized This review protocols tries and to present to conduct the the and the utilization of FMT.
relationship between gut flora and diseases 2013 Baishideng Publishing Group Co., Limited. All rights reserved.
Key Words: Clostridium Fecal microbiota transplantation; Re-current difficile infection; Inflammatory bowel disease; Intestinal microbiota
Cui microbiota transplantation: from the 4BT, Wang M, Ji GZ, Fan ZN, Zhang th FM. Fecal Shijie Huaren Xiaohua Zazhi 2013; 21(30): 3222-3229 century to 2013. URL: http://www.wjgnet.com/1009-3079/21/3222.asp DOI: http://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v21.i30.3222
摘要
肠微生态是人的一个特殊器官, 肠微生态失常与肠内外多种疾病密切相关. 一种将健康人肠道功能菌群分离后移植到患者肠道内, 通过重建患者肠道菌群而治病的方法, 被称为粪菌移植(fecal microbiota transplantation, FMT). 虽然FMT 起源于中国公元400年前, 但是, 时至近年才受到广泛关注. 尽管其已经于2013年写入难辨梭状芽孢杆菌感染的临床治疗指南, 还用于治疗炎症性肠病、免疫缺陷性肠病、代谢综合征等, 但有关其机制、技术标准化、安全性评估等方面尚处于起步阶段. 本文就肠道菌群与疾病、FMT 的起源和发展、FMT 的前景等进行综述.
2013年版权归百世登出版集团有限公司所有.
关键词: 粪菌移植; 难辨梭状芽胞杆菌; 炎症性肠病; 肠微生态
核心提示: 本文系统回顾了粪菌移植(fecal micro-biota transplantation, FMT)的医学史、临床应用、存在的问题、中国对标准化FMT 的贡献, 展示了本领域的研究方向.
崔伯塔, 等. 粪菌移植: 公元4世纪至2013年 崔伯塔, 王敏, 季国忠, 范志宁, 张发明. 粪菌移植: 公元4世纪至2013年. 世界华人消化杂志 2013; 21(30): 3222-3229 URL:
http://www.wjgnet.com/1009-3079/21/3222.asp DOI:
http://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v21.i30.3222
0 引言
人的肠道微生态系统极其复杂, 一个健康人的肠道内约存在1000-1150种细菌[1]
, 总数达到100万亿左右[2]. 肠道菌群参与维持肠道的正常生理功能和机体免疫功能[3]. 然而, 人类肠道菌群的组成因遗传、生活环境、饮食习惯和抗生素使用等因素的影响而存在个体差异和地域差别[4-8]. 这是人类至今对其认知尚少的主要原因.
正常状态下, 肠道微生物在各种反馈作用机制的调节下维持肠道微生态系统的多样性和稳定性. 研究发现, 相比于人体其他部位(皮肤、口腔), 肠道菌群的组成能长期保持相对稳定[9,10]. 肠道菌群的多样性受遗传、饮食、年龄、环境、区域差异和抗生素使用等因素的影响, 当肠道细菌的多样性下降会破坏菌群的稳定性. 如长期的高糖高脂饮食或使用抗生素会降低肠道菌群的多样性, 导致肠道菌群紊乱, 进而引发相关疾病[4,6,7]. 目前研究发现, 肠道菌群紊乱与多种肠道和肠道外疾病相关[11], 如炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)
[12,13]、肠易激
综合征[14,15]、肥胖[16]、代谢综合征[17]、神经系统紊乱[18]、慢性疲劳综合征[19]、免疫系统疾病[20]、肿瘤等[21](表1). 尽管在某些疾病中已经发现肠道菌群会发生特异性的改变(某些严重的肠道疾病、肿瘤和肥胖) [11], 但由于个体肠道菌群的多样性及其他微生物、化学物质的存在, 很难在疾病和特异性菌群改变之间建立明确的因果关系. 不过基于对“肠道菌群紊乱在疾病发生中作用”的认识, 医生们产生了用健康人肠道细菌来治疗人类疾病的想法. 1958年, 美国的Ben Eiseman 医生及其同事首次用健康人的粪便成功治愈了4例严重的伪膜性肠炎患者[22], 开启了现代医学关于粪菌移植(fecal microbiota transplantation, FMT)的新篇章.
本文从起源、发展和应用几个方面, 对F M T 的研究现状进行全面综述, 并提出目前FMT 发展存在的问题和下一步的发展前景. 1 FMT的起源与发展
追溯FMT 的起源, 最早用于治疗人类疾病疾病的文字记载是中国东晋时期(公元300-400年) 葛
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表 1 肠道菌群紊乱相关的疾病[21]
■研发前沿
本文系统回顾了FMT 的临床应用历史和现状, 重点强调标准化F M T (包括粪菌库) 、肠道宏基因组研究的需要和前景.
洪所著的《肘后备急方》(也称《肘后方》), 文中描述用人粪清治疗食物中毒、腹泻、发热并濒临死亡的患者, “饮之, 即活”[28]. 中国明代李时珍所著的《本草纲目》(1596年版) 记载了多达二十多种用人粪治病的疗方[29]. 尽管那时世人还不知道细菌, 但已经运用新鲜的粪水、发酵的粪水等含有大量活菌的物质来治病. 中国传统医学中, 此类应用并非罕见, 但是由于近几十年国家中医药相关法规对中药卫生方面的要求, 利用人粪入药已经被不断更新的国家药典书籍删除, 不过, 不少中国高龄的民间医生都熟悉此类疗法. 在西方医学中关于粪便治疗疾病的记载最早出现于1697年, 由一位叫Franz Paullini 的德国医生所著的书《H eilsame Dreck-Apotheke 》, 该书收集了众多用人或动物的粪便来治疗各种疾病的方法, 重点介绍粪便广泛的医用价值, 包括从头到脚所有可能的应用[30,31]. 近代关于FMT 的文献报道可以追溯到1958年, 美国科罗拉多大学医学院外科医生Ben Eiseman 及其同事[22], 利用健康人的大便制成粪水对4例常规抗生素、激素治疗无效的严重伪膜性肠炎患者实施灌肠. 结果成功治愈其中3例垂危患者, 另1例患者死于与肠道感染无关的其他疾病. 但由于种种原因, 在这之后的二十年, FMT 并没得
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■相关报道
到很好的发展. 直到1978年, 难辨梭状芽孢杆菌本文再现了FMT 的医学史, 全面展感染(clostridium difficile infection, CDI), 被认为示了FMT 在临床上的一些里程碑是腹泻和伪膜性肠炎的主要原因, 用粪菌治病的式的应用. SMT的方法才逐渐得到重视. 1981年美国Bowden 等[32]应用和概念为读者带来了更多的报道用经小肠置管输入粪液的方法, 成功治愈启示.
16例伪膜性肠炎患者; 1983年, 瑞典的Schwan 等[25]在《柳叶刀》发文, 用粪便菌液对复发性CDI 患者进行直肠灌肠, 获得很好的疗效, 这是FMT 首次用于治疗CDI 患者. 目前FMT 已经在美国、加拿大、澳大利亚、荷兰和英国等国家广泛开展[33]. 2012年10月南京医科大学第二附属医院消化医学中心的张发明及其同事成功将FMT 标准化(包括菌群分离的标准化、移植前后的准备流程等), 用于难治性IBD 等复杂肠病的挽救治疗, 并在美国临床试验网站(www.clinicaltri-als.gov) 注册了3项临床试验(NCT01790061、NCT01790711、NCT01793831).
FMT 的最新医学史由张发明等[34]在Ameri-
can Journal of Medicine发表, 并已经被New Eng-land Journal of Medicine等杂志[21,35,36]引用. 尽管FMT 起源于1700年前, 但其发展最快的却是最近3年. 在中国现代医学史上, 倡导标准化、人性化的FMT 始于2012年, 相关文献[33,34,37-39]和临床试验随之逐渐出现. 2013年初, FMT 治疗方案被列入美国治疗CDI 的临床指南. 然而就在医学界和遭受疾病困扰的患者对FMT 充满期待之际, 2013-05-02, 美国食品药品管理局(Food and Drug Administration, FDA) 的一项规定对FMT 的发展产生一定的影响. 美国生物制品评价与研究中心(Center for Biologics Evaluation and Research, CBER) 将FMT 定义为生物产品和药品, 归属FDA 管理. 尽管FDA 批准将FMT 用于治疗复发性CDI, 但这一定义意味着如果要进行FMT 治疗, 医生必须先提交研究性新药(investi-gational new drug, IND) 申请, 注明具体操作步骤, 纳入和排除标准、治疗过程中不良反应的处理等, 等待FDA 的批准, 这一周期约需30个工作日[40]. 虽然FDA 允许在特殊情况下通过电话申请紧急FMT 治疗, 不过在大多数的临床医生看来, 这很大程度上阻碍了FMT 的运用和发展. 在2013-05下旬的美国消化病周(Digestive Disease Week, DDW)期间, 在一个FMT 的专场会议上, 来自美、欧、亚等专家对此进行了群情激奋的讨论. 不过, 如果换个角度思考FDA 的这一决定, 该规定表明F D A 已经认可F M T 在治疗人类疾病的疗效, 只是需要进一步的证
据来证明该产品的安全性以及可能产生的不良反应, 可以视为鼓励进一步深入探讨和了解FMT 的举措. 2 FMT的应用
自从1958年美国科罗拉多大学医学院Ben Eise-man 医生及其同事开展了FMT 以来, 迄今已经有大量临床研究报道利用FMT 治疗多种疾病(表2), 包括伪膜性肠炎[22,32,41]、慢性便秘与IBD [13]、难辨梭状芽胞杆菌性肠炎[42,43]等胃肠道疾病, 以及肠道外疾病, 如代谢综合征[17]、慢性疲劳综合征[19]、代谢性酸中毒[44]、多发性硬化[26]等.
2.1 FMT与CDI 据统计美国医院每年新发CDI 的病例50-70万[48]. 一线治疗措施如甲硝唑、万古霉素治疗后, CDI 的首次复发率为15%-30%, 二次复发率达到40%, 三次复发率则达到65%[49,50]. CDI 的高复发率促使人们尝试寻求新的治疗措施, 1983年Schwan 医生首次利用FMT 成功治愈难治性CDI 肠炎的患者. 目前FMT 因其明显高于传统的万古霉素治疗的治愈率和低复发率, 已经被广泛用于救治复发性CDI [25]. 据统计, 截止2012年, 有十几项研究报告均报道FMT 能有效治疗复发性或慢性CDI, 经FMT 治疗的CDI 病例已超过500例[51,52], 有效率达95%[52]. 最近一项针对FMT 用于治疗CDI 的多样本、系统性调查研究表明在对70例CDI 患者行经结肠灌注的FMT 治疗后, 治愈66例, 治愈率达94%[53]. 2013年New England Journal of Medicine发表了第一项利用FMT 治疗复发性CDI 的临床对照研究, 该研究将42例RCDI 患者随机分成3组, 分别接受标准14 d 500 mg 万古霉素治疗, 口服4次/d; 标准万古霉素治疗加肠道灌洗; 4 d 500 mg 万古霉素治疗, 口服4次/d, 加肠道灌洗, 继而经鼻十二指肠管行FMT 治疗. 以艰难梭菌感染引起的腹泻终止, 10 wk 内无复发为试验主要终点. 该实验中期分析结果显示, FMT 治疗组的16例患者中, 有13例在接受第1次FMT 后便治愈, 剩下的3例在接受第2次FMT 后, 有2例治愈, 治愈率达到94%; 相比之下, 万古霉素单药的治疗13例患者中只有4例感染被清除, 成功率为31%. 而万古霉素加灌洗组成功率仅为23%[54]. 但该实验被医学伦理委员会提前终止. 由于FMT 对RCDI 的高治愈率, 目前已有医生建议将FMT 作为治疗严重难辨梭状芽胞杆菌感染的一线疗法[55]. 2013年, 美国CDI 治疗指南将FMT 治疗推荐用于第3次复发患者[47].
崔伯塔, 等. 粪菌移植: 公元4世纪至2013年
表 2 粪菌移植用于治疗人类疾病代表性文献
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■应用要点
本文对FMT 的综述有重要的临床指导意义.
2.2 FMT与IBD IBD包括克罗恩病和溃疡性结肠炎, 目前发病机制仍不清楚. 有研究认为克罗恩病的发病可能与副结核分枝杆菌和侵袭性大肠杆菌[14]等特殊细菌感染有关. 但溃疡性结肠炎病例中尚未分离出特异性的感染源. 另一种假说认为, IBD 因具有遗传倾向性的宿主受到肠道内非致病性共生菌抗原的长期刺激, 肠道发生持续的免疫系统超敏反应, 导致肠道内环境失衡和致肠道菌群的紊乱所致[14,56]. 研究表明, IBD患者肠道内菌群多样性下降约30%-50%[56,57].
但到目前为止, FMT 用于治疗IBD 的报道很少. 自1989年Bennet 首次成功治愈一例严重的溃疡性结肠炎患者以来, 共报道9例溃疡性结肠炎患者经FMT 治疗, 6 wk 内痊愈且无反复. 经13年的随访和结肠镜检查, 其中6例无复发, 2例仅有轻微的慢性炎症[13,57,58-60]. FMT 报道用于治疗克罗恩病的仅有1例, 在常规泼尼松和柳氮磺胺
吡啶治疗无效后尝试FMT 治疗, 3 d 内得到有效缓解, 但在第18个月复发[60]. 此外Brandt 在ACG 2012年会上的报告显示, 8例溃疡性结肠炎患者经结肠内镜下行FMT 治疗后, 以粪便灌肠作为维持治疗, 结果7例的粪便频次和腹痛有明显改善. 但个体的缓解程度差异较大, 其中伴随CDI 感染的病例(3例) 、最新诊断为溃疡性结肠炎且刚开始使用抗生素的病例(1例) 以及那些肠道能更好地滞留灌肠剂的患者, FMT 治疗的效果更明显[61].
FMT 可以有效地治疗溃疡性结肠炎, 但是可能需要经过多次FMT 来维持疗效. 另外FMT 可能对因使用抗生素或因肠道内感染所致肠道菌群紊乱的结肠炎更有效. 目前FMT 对IBD 的治疗还处于起步阶段, 需要大量的工作如临床对照试验来验证. 南京医科大学第二附属医院的复杂肠病中心首次利用标准化经中消化道
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■同行评价
本文全面综述了F M T 治疗难治性溃疡性结肠炎和克罗恩病患FMT 在临床疾病者(NCT01790061、NCT01793831), 前期结果治疗中的历史发展、临床应用、充分显示临床起效迅速, 长期疗效也鼓舞人心适应症以及作用(待发表).
机制, 具有一定指导意义.
2.3 FMT 与肠易激综合征和慢性便秘 肠易激综合征的发病被认为与急性胃肠炎所致的胃肠内菌群改变有关. 研究表明以便秘为主要症状的肠易激综合征患者肠道内硫酸盐还原菌的数量明显上升[62]. 1989年, Borody 医生报道了首次通过肠镜FMT 治疗55例肠易激综合征和慢性便秘患者, 其中20例治愈, FMT 的治愈率达到36%; 9例有症状明显改善, 占16%; 治疗失败的为26例, 占47%. 在另一份系列病案报告中, 45例慢性便秘的病例通过结肠镜行FMT 治疗后, 40例(89%)患者的排便、腹胀和腹痛立刻缓解. 在对其中的30例进行随访后发现, 18例在9-18 mo 后仍能在不需要泻药的帮助下正常排便[63].
2.4 FMT 与其他肠病及肠外疾病 肠道菌群的紊乱除可以导致肠道内疾病外还与多种肠道外疾病相关, 或者肠内外疾病导致肠道菌群异常, 进而加重原有疾病或导致新的相关疾病. 目前已报道的可以用F M T 治疗的肠道外疾病包括自身免疫性疾病(如特发性血小板减少性紫癜
[20]
、多发性硬化、肌张力障碍), 神经系
统疾病(如帕金森病)
[18]
、自闭症
[24]
、慢性疲劳综合征19]
、代谢综合征和肥胖等
[17]
(表2), 但
由于很多报道仅是病例报告, 其具体的有效性还需要大量的临床随机对照试验来验证. 我们的临床试验(NCT01790711)也发现对提高胰岛素敏感性有明显疗效, 还用FMT 成功治疗顽固性老年便秘、糖尿病合并神经病变、难治性显微镜下肠炎、难治性肠功能紊乱、嗜酸性粒细胞肠炎、放射性肠炎等. 3 结论
迄今为止, FMT 的发展尚处于起步阶段, 其具体作用机制尚不清楚. 目前普遍被接受的观点认为, FMT 主要是功能菌群移植, 利用健康人群的肠道菌群重建肠道微生态环境的稳态, 以达到治病的目的[37]. 不过最近有新的观点认为, FMT 的作用机制可能是一种冲击治疗, 通过一次性大量植入外源性健康菌群, 冲击患者肠道内紊乱菌群, 在供体健康菌群的诱导下, 促进受体肠道菌群恢复正常[64]. 我们目前还没法证明哪种假说更准确, 但毫无疑问只有彻底探明FMT 的作用机制, 才能更好地指导FMT 治疗. 目前很多
课题组正在为此而努力, 南京医科大学第二附属医院复杂肠病团队收集了患者在FMT 治疗前和治疗后的粪便和体液标本, 通过宏基因组的检测, 分析前后菌群的结构和数量的变化, 期望查明F M T 在治疗炎症性肠病患者中的作用机制. 尽管FMT 已经被用于RCDI 、IBD 、IBS 等疾病的治疗, 并取得良好疗效, 但由于FMT 过去的发展根本上受限于没有标准化的方法和系统的流程. 经过研究, 我们已经建立了从供受体的筛选、菌群分离、移植途径、移植量、移植术前和术后的流程等规范化方案, 还建立了中国第一个粪菌库.
随着全世界对FMT 的重视, FMT 将会得到更为迅速的发展. 最近, Petrof 等[65]从健康人粪便分离出的33种细菌, 培养后制成细菌混合物, 利用常规FMT 途径成功治愈两例RCDI 患者, 揭示用粪人工组合菌群治疗(synthetic microbiota transplantation, SMT) 代替FMT 的可能性. 如果可以通过人工培养特定的细菌, 并组合成最佳比例和数量级的菌群, 实现标准化SMT, 不但可以确保细菌来源的安全性和可控性, 进行有效质控, 减少供体筛查环节, 同时还可以将人工合成的细菌做成冻干粉或胶囊, 以处方药的形式直接口服或经内镜直接输入肠道. 因此, SMT 将是FMT 或者肠道菌群干预治疗的重要发展方向. 基于FMT 的疗效带给科学家的启示和肠道菌群宏基因组的研究, 发现和开发新的菌群干预靶标或途径, 也是一个重要的新技术转化领域. 无论是既往存在、还是新兴的益生菌制药企业, 相关研发与市场竞争, 已是暗流涌动. 4 参考文献
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编辑 田滢 电编 闫晋利
ISSN 1009-3079 (print) ISSN 2219-2859 (online) DOI: 10.11569 2013年版权归Baishideng 所有
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《世界华人消化杂志》参考文献要求
本刊讯 本刊采用“顺序编码制”的著录方法, 即以文中出现顺序用阿拉伯数字编号排序. 提倡对国内同行近年已发表的相关研究论文给予充分的反映, 并在文内引用处右上角加方括号注明角码. 文中如列作者姓名, 则需在“Pang 等”的右上角注角码号; 若正文中仅引用某文献中的论述, 则在该论述的句末右上角注码号. 如马连生[1]报告……, 潘伯荣等[2-5]认为……; PCR方法敏感性高[6-7]. 文献序号作正文叙述时, 用与正文同号的数字并排, 如本实验方法见文献[8]. 所引参考文献必须以近2-3年SCIE, PubMed,《中国科技论文统计源期刊》和《中文核心期刊要目总览》收录的学术类期刊为准, 通常应只引用与其观点或数据密切相关的国内外期刊中的最新文献, 包括世界华人消化杂志(http://www.wjgnet.com/1009-3079/index.jsp)和World Journal of
Gastroenterology (http://www.wjgnet.com/1007-9327/index.jsp). 期刊: 序号, 作者(列出全体作者). 文题, 刊名, 年,
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