基因工程原理习题
1、假如从一个原核生物中cloning某基因(1-2kb),
请谈谈它的基本步骤?
①限制性内切酶切割外源DNA和载体 ②将外
源DNA片段与载体连接 ③转化 ④筛选
2、什么叫基因工程(GeneEngineering),试从理
论和技术两个方面谈谈GeneEngineering诞生的基
础?
基因工程:在体外将核酸分子插入病毒、质粒
或其它载体分子,构成遗传物质的新组合,并使之
参入到原来没有这类分子的宿主细胞内,而能持续
稳定地繁殖。
理论基础:近几十年来,由于受到分子生物学、
分子遗传学发展的影响,基因分子生物学的研究取
得了前所未有的进步。而这些学科的综合成就,又
为基因工程的诞生奠定了坚实的理论基础:
①在40年代确定了遗传信息的携带者,即基
因的分子载体是DNA而不是蛋白质,从而明确了遗
传的物质基础问题;
②在50年代揭示了DNA分子的双螺旋结构模
型和半保留复制机理,解决了基因的自我复制和传
递的问题;
③在50年代末期和60年代,相继提出了"中
心法则"和操纵子学说,并成功地破译了遗传密码,
从而阐明了遗传信息的流向和表达问题。
技术基础:
①60年代-70年代,限制性核酸内切酶和DNA连
接酶解决了对DNA分子进行体外的切割和连接;
②基因克隆载体的出现
③大肠杆菌转化体系的建立
④60年代发展的琼脂糖凝胶电泳和Southern转
移杂交技术对DNA片段的分离和检测十分有用。
3、基因克隆、基因操作、基因重组、基因工程的概
念及其相互联系。
基因克隆(Genecloning):是指对基因进行分
离和扩大繁殖等操作过程,其目的在于获得大量的
基因拷贝,在技术上主要包括载体构建、大肠杆菌
遗传转化、重组子筛选和扩大繁殖等环节。
基因工程:是通过基因操作,将目的基因或DNA
片段与合适的载体连接转入目标生物细胞,通过复
制、转录、翻译外源目的基因以及蛋白质的活性表
达,使转基因生物获得新的遗传性状的操作。
基因操作:对基因进行分离、分析、改造、检
测、表达、重组和转移等操作的总称。
基因重组:不同来源DNA分子通过共价连接(磷
酸二酯键)而组合成新的DNA分子的过程。
它们的相互关系:基因工程是通过基因重组实
现的,但基因重组并不都是严格意义上的基因工程,
基因重组是基因操作范畴的概念,包括实验研究和
生物技术的基因重组事件,而基因工程则专指为实
践应用而进行的重组事件。基因操作是基因工程的
技术基础;基因克隆很多时候并不涉及遗传的改良。
4、为什么说基因工程是生物学和遗传学发展的必然
产物?
生物学和遗传学发展到现在无非就是向两个方
向发展,宏观和微观的,宏观发展无非就性状研究,
外观特征等,而微观方面就是像小分子方向基因,
蛋白等方面发展,而研究和链接这两方面的桥梁就
基因工程技术。
第二章分子克隆工具酶
1、限制性内切酶可划分为哪几个类型,各自有何特
点?
根据酶的结构、作用的不同,可将限制性
内切酶分为三种类型。Ⅱ型限制性内切酶具有
高度特异性的DNA裂解点,而Ⅰ型和Ⅲ型兼有
修饰(甲基化)作用和依赖于ATP的活性,但
不能在识别序列上直接裂解DNA,故用途较少。
因此,Ⅱ型限制性内切酶是基因工程和基因诊
断中重要的工具酶,通常不特别说明的即为Ⅱ
型限制性内切酶。
2、哪些酶可用于DNA片段的末端标记?
KlenowDNA聚合酶和T4或T7DNA聚合酶在对
DNA片段进行末端补平反应或末端的置换反应时可
引入标记的核苷酸。
3、DNA聚合酶有哪些类型,各有什么活性?
①E.coliDNApolI:5’-3’DNA聚合酶活性;5’
-3’DNA外切酶活性;3’-5’DNA外切酶活性。
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②E.coliDNApolI大片段(Klenow酶):5′→3′
DNA聚合酶活性;3′→5′DNA外切酶活性;5’-3’
DNA外切酶活性。
③T4噬菌体DNApol:5′→3′DNA聚合酶活性(与
Klenow酶相似);3′→5′外切酶活性(Klenow
酶×200):在无dNTP时只有该活性。(常用于填平
dsDNA的3′缩进末端及水解dsDNA的3′突出末
端。)
④T7噬菌体DNApol及测序酶:5′→3′DNA聚合
酶活性; 3′→5′外切酶活性(Klenow酶×
1000)。
⑤耐热DNA聚合酶(Taq酶):在高温下仍具活性
的DNA聚合酶。5′→3′DNA聚合酶活性;5’-3’
DNA外切酶活性。
⑥反转录酶(依赖于RNA的DNApol):5’→3’DNA
聚合酶活性(需Mg
2+
);RNaseH活性(5’→3’及3’
→5’RNA外切核酸酶活性);
⑦末端转移酶(terminaltransferase)(DNA修饰
酶):不依赖于模板的DNA聚合酶,在二价阳离子存
在下,催化dNTP加在DNA分子的3′-OH端。
4、在分子克隆中所用的酶主要作用于哪些底物?
限制性内切酶(又称内切限制酶或限制酶)作
用底物:识别和切割双链DNA分子中某种特定核苷
酸序列。
连接酶作用底物:将双螺旋DNA分子的某一条
链上两个相邻核苷酸之间失去一个磷酸二酯键所出
现的单链缺口封闭起来。
修饰酶作用底物:能催化稀有碱基参入RNA或
DNA,或对原有碱基进行修饰,以防止限制性内切酶
的破坏。
第三章分子克隆
1、何为载体?一个理想的载体应具备那些特点?
将外源DNA或基因携带入宿主细胞(host
cell)的工具称为载体
载体具备的特点:
①在宿主细胞内必须能够自主复制(具备复制原点)
②必须具备合适的酶切位点,供外源DNA片段插入,
同时不影响其复制
③有一定的选择标记,用于筛选
④最好具有较高的拷贝数,便于制备
2、作为一个最基本的载体,它必须具备哪些功能元
件?
克隆载体:复制起点ori、酶切位点、筛选标志;
表达载体:启动子、酶切位点、转录终止序列、筛
选标志,原核表达载体还要有SD序列。
3、抗性基因(Resistantgene)是目前使用的最广
泛的选择标记,常用的抗生素抗性有哪几种?并举
两例说明其原理?
氨苄青霉素抗性基因ampr 、四环素抗性基因
tetr、氯霉素抗性基因Cmr、卡那霉素和新霉素
抗性基因kanr
①氨苄青霉素抗性基因ampr:
青霉素可抑制细胞壁肽聚糖的合成,与有关的酶结
合并抑制其活性,抑制转肽反应.氨苄青霉素抗性
基因编码一个酶,该酶可分泌进入细菌的周质区,
抑制转肽反应并催化b-内酰胺环水解(水解青霉
素),从而解除了氨苄青霉素的毒性。
②四环素抗性基因tetr:
四环素可与核糖体30S亚基的一种蛋白质结合,从
而抑制核糖体的转位。四环素抗性基因编码一个由
399个氨基酸组成的膜结合蛋白,可阻止四环素进
入细胞。
4、为什么野生的λ噬菌体DNA不能直接用于基因工
程的载体?应该怎样对其进行改造来构建λ噬菌体
克隆载体?
不适宜的原因:
①噬菌体DNA没有容载能力,因为噬菌体的头部对
DNA包装的量是有限制的,不能大于基因组的105%,
所以要将λ噬菌体改造成载体,必须削减分子量。
②野生型的λDNA对于一些常用的酶都有多个识别
和切割位点,不便于克隆。
③没有可供选择的标记。
④野生型的λ噬菌体具有感染性,因此不够安全。
改造:①去掉基因组中一部分对裂解生长非必须的
DNA片段
②消去一些多余的限制性内切酶识别与切割位点,
也可以引入多克隆位点MCS
③添加合适的遗传标记便于筛选
5、YAC载体具有什么样的功能性DNA序列?为什么在
克隆大片段时,YAC具有优越性?
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YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝
粒,一个DNA复制起点,两个端粒。
YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏
粒办不到的。大片段的插入可能包含完整的基因,
在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能
够减少完整基因组文库所需的克隆数目。
6、何为α-互补,在载体构建中有何作用?
答:α-互补:指lacZ基因上缺失近操纵基因区
段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半
乳糖苷酶(β-galactosidase,由1024个氨基酸
组成)阴性的突变体之间实现互补。α-互补是基于
在两个不同的缺陷β-半乳糖苷酶阴性的突变体之
间可实现的功能互补而建立的。
将缺失编码第11-41位氨基酸的β-半乳糖苷酶基
因称为lacZ△M15基因而将半乳糖苷酶基因(lacZ)
的调控序列和编码β-半乳糖苷酶N端140个氨基酸
的序列称为lacZ’.这两个基因的产物单独存在时
都无酶学活性,但混合在一起时却有酶学活性.所以
在载体上加lacZ’/(MSC),并在受体菌中引入lacZ
△M15即可实现α-互补.IPTG是lac操纵子的诱导
物,底物X-gal被β-半乳糖苷酶分解后可以产生蓝
色.如果质粒载体中插入了外源DNA, lacZ’的产
物则不能与lacZ△M15基因的产物实现α-互补,在
IPTG诱导下不能产生有活性的β-半乳糖苷酶,菌
落便不可能呈现蓝色。白色菌落便是含有插入了外
源DNA的重组质粒。因此可利用菌落颜色变化来筛
选插入外源DNA的重组质粒。
这种方法是根据组织化学的原理来筛选重组体。主
要是在λ载体的非必要区插入一个带有大肠杆菌β
-半乳糖苷酶的基因片段,携带有lac基因片段的λ
载体转入lacˉ的宿主菌后,在含有5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal)平板上形成白色的噬
菌斑,非重组的噬菌体则为蓝色噬菌斑。
第四章大分子分离和分析
1、分析比较琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳
的异同点?
同:①原理相同。琼脂糖、聚丙烯酰胺均
为无反应活性的稳定支持介质,可降低对流运动,
故使电场中的分子电泳迁移率仅与分子的摩擦系数
成反比。在一定电场强度下,DNA分子的迁移率取
决于核酸分子的大小和构象。
②凝胶浓度的高低影响凝胶介
质孔隙大小;浓度越高,空隙越小,其分辨能力也
就越强;反之,浓度降低,空隙就增大,其分辨能
力也就随之减弱。
异:琼脂糖凝胶分辨DNA片段的范围为
02.Kb-50Kb之间;而聚丙烯酰胺分辨DNA片段的范
围为1-1000bp,分离小片段效果最好,分辨率极高,
相差1bp的DNA也可分开。
2、琼脂糖凝胶电泳中,简述影响DNA在凝胶中迁移
速率的因素?
DNA构象、分子量大小、碱基组成与温度、
琼脂糖浓度、嵌入染料EB存在与浓度、电压、电场
方向、电泳缓冲液
3、小量制备质粒DNA,用质粒中特定的酶切发现切
割不动,试分析可能原因及克服方法?
最可能的原因:从细菌沉淀或从核酸沉淀中
吸上清时注意不够,带了杂蛋白。其最根本的原因
是因为细菌的细胞壁成分或核内某些蛋白质可能抑
制限制酶活性。
克服方法:用酚氯仿对溶液抽提;用离心柱
层析法纯化DNA。
4、什么是Western blot?它和Southern blot
有何区别?
Western印迹是将蛋白质经电泳分离后从
凝胶中转移到固相支持物上,然后用特异性的抗体 进行检测。
它与Southern的不同在于探针的性质不
同,在Western印迹中使用的探针是抗体(蛋白质)。
5、印迹分子杂交有哪些种类,并说明在什么情况下 需要使用这些方法。
答:Southern杂交是以DNA或RNA为探针,检测DNA 链,用于外源基因整合的鉴定及分析。Northern杂
交是以DNA或RNA为探针,检测RNA链,用于外源 基因转录产物特异mRNA的检测。Western杂交是利 用抗原与抗体的特异结合的原理检测外源基因表达 产物特异蛋白质的生成。
6、核酸分子标记有哪些方法,各有何特点?
(一)均匀标记:需要复制一段新的探针分子,在复 制过程中掺入标记的核苷酸,从而使整个新分子被 心相印图文工作室整理luqiu910
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均匀地标记.显著特点是探针分子的标记不局限在 一个位点上,因此,均匀标记可使探针的标记信号扩 大,得到高比活度的探针.
(1)切口平移标记,新合成的被标记的分子可以代 表该待标记DNA分子的绝大部分核苷酸序列.
(2)随机引物标记,扩增出来的DNA产物包括从任 意某个位点起始的单链DNA片段,产物群体包含了 目的DNA所有核苷酸序列信息,多用来标记DNA片 段.
(3)PCR扩增标记,尤其适合于探针DNA浓度很低 的情形.(4)单链探针,不存在互补双链,因此可以 消除探针的两条链在杂交过程中形成无效双链的可 能性,从而增加探针与靶序列探针与靶序列之间形 成杂合体的稳定性,提高检测的灵敏度.
(二)末端标记:直接将探针分子的某个原子替换为 放射性同位素原子,或直接在探针分子上加入标记 的原子或复合物。
(1)DNA片段的末端标记,末端标记主要通过酶促 反应来完成,KlenowDNA聚合酶和T4或T7DNA聚 合酶在对DNA片段进行末端补平反应或平末端的置 换反应时可引入标记的核苷酸.。
(2)寡核苷酸的标记,合成的寡核苷酸主要通过T4 多核苷酸激酶在5′末端引入标记的磷酸基团进行 标记,也可利用末端转移酶在3′末端连接标记的核 苷酸.
7、DNA转化有哪些方法,各有何优点? 钙处理,钙可以获得感受态的细胞,这是实验
室最常用的方法,它可以用于大多数的DNA转化。 其他化学处理,这种方法比钙处理的方法要更
复杂,但它获得高感受态的细胞。这可以用于构建基 因库或是当你有少量非常珍贵的DNA。
电穿孔、级差非常高,但是要限制DNA中盐的 浓度。